Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cln8Q9QUK3 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cln8Q9QUK3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cln8Q9QUK3 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cln8Q9QUK3 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cln8Q9QUK3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cln8Q9QUK3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cln8Q9QUK3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cln8Q9QUK3 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cln8Q9QUK3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cln8Q9QUK3 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cln8Q9QUK3 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cln8Q9QUK3 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cln8Q9QUK3 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cln8Q9QUK3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cln8Q9QUK3 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cln8Q9QUK3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cln8Q9QUK3 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Cln8Q9QUK3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cln8Q9QUK3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cln8Q9QUK3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cln8Q9QUK3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cln8Q9QUK3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cln8Q9QUK3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cln8Q9QUK3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cln8Q9QUK3 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cln8Q9QUK3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cln8Q9QUK3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cln8Q9QUK3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cln8Q9QUK3 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cln8Q9QUK3 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cln8Q9QUK3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cln8Q9QUK3 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cln8Q9QUK3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cln8Q9QUK3 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cln8Q9QUK3 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cln8Q9QUK3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Cln8Q9QUK3 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cln8Q9QUK3 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Cln8Q9QUK3 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cln8Q9QUK3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cln8Q9QUK3 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cln8Q9QUK3 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cln8Q9QUK3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cln8Q9QUK3 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cln8Q9QUK3 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cln8Q9QUK3 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cln8Q9QUK3 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cln8Q9QUK3 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cln8Q9QUK3 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cln8Q9QUK3 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cln8Q9QUK3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cln8Q9QUK3 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cln8Q9QUK3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cln8Q9QUK3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cln8Q9QUK3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cln8Q9QUK3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cln8Q9QUK3 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cln8Q9QUK3 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cln8Q9QUK3 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cln8Q9QUK3 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cln8Q9QUK3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cln8Q9QUK3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cln8Q9QUK3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cln8Q9QUK3 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cln8Q9QUK3 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cln8Q9QUK3 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cln8Q9QUK3 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cln8Q9QUK3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cln8Q9QUK3 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cln8Q9QUK3 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cln8Q9QUK3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cln8Q9QUK3 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cln8Q9QUK3 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cln8Q9QUK3 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cln8Q9QUK3 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cln8Q9QUK3 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cln8Q9QUK3 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cln8Q9QUK3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cln8Q9QUK3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cln8Q9QUK3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cln8Q9QUK3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cln8Q9QUK3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cln8Q9QUK3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cln8Q9QUK3 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cln8Q9QUK3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cln8Q9QUK3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cln8Q9QUK3 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cln8Q9QUK3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cln8Q9QUK3 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cln8Q9QUK3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cln8Q9QUK3 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cln8Q9QUK3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cln8Q9QUK3 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cln8Q9QUK3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cln8Q9QUK3 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cln8Q9QUK3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cln8Q9QUK3 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cln8Q9QUK3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cln8Q9QUK3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms