Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM62

Reep6, Receptor expression-enhancing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep6Q9JM62 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Reep6Q9JM62 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Reep6Q9JM62 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Reep6Q9JM62 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Reep6Q9JM62 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Reep6Q9JM62 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Reep6Q9JM62 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Reep6Q9JM62 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Reep6Q9JM62 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Reep6Q9JM62 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Reep6Q9JM62 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Reep6Q9JM62 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Reep6Q9JM62 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Reep6Q9JM62 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Reep6Q9JM62 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Reep6Q9JM62 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Reep6Q9JM62 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Reep6Q9JM62 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Reep6Q9JM62 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Reep6Q9JM62 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Reep6Q9JM62 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Reep6Q9JM62 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Reep6Q9JM62 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Reep6Q9JM62 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Reep6Q9JM62 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Reep6Q9JM62 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Reep6Q9JM62 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Reep6Q9JM62 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Reep6Q9JM62 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Reep6Q9JM62 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Reep6Q9JM62 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Reep6Q9JM62 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Reep6Q9JM62 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Reep6Q9JM62 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Reep6Q9JM62 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Reep6Q9JM62 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Reep6Q9JM62 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Reep6Q9JM62 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Reep6Q9JM62 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Reep6Q9JM62 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Reep6Q9JM62 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Reep6Q9JM62 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Reep6Q9JM62 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Reep6Q9JM62 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Reep6Q9JM62 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Reep6Q9JM62 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Reep6Q9JM62 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Reep6Q9JM62 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Reep6Q9JM62 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Reep6Q9JM62 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Reep6Q9JM62 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Reep6Q9JM62 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Reep6Q9JM62 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Reep6Q9JM62 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Reep6Q9JM62 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Reep6Q9JM62 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Reep6Q9JM62 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Reep6Q9JM62 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Reep6Q9JM62 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Reep6Q9JM62 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Reep6Q9JM62 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Reep6Q9JM62 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Reep6Q9JM62 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Reep6Q9JM62 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Reep6Q9JM62 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Reep6Q9JM62 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Reep6Q9JM62 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Reep6Q9JM62 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Reep6Q9JM62 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Reep6Q9JM62 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Reep6Q9JM62 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Reep6Q9JM62 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Reep6Q9JM62 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Reep6Q9JM62 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Reep6Q9JM62 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Reep6Q9JM62 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Reep6Q9JM62 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Reep6Q9JM62 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Reep6Q9JM62 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Reep6Q9JM62 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Reep6Q9JM62 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Reep6Q9JM62 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Reep6Q9JM62 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Reep6Q9JM62 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Reep6Q9JM62 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Reep6Q9JM62 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Reep6Q9JM62 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Reep6Q9JM62 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Reep6Q9JM62 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Reep6Q9JM62 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Reep6Q9JM62 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Reep6Q9JM62 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Reep6Q9JM62 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Reep6Q9JM62 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Reep6Q9JM62 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Reep6Q9JM62 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Reep6Q9JM62 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Reep6Q9JM62 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Reep6Q9JM62 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Reep6Q9JM62 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.1 ms