Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF6

Nectin1, Nectin-1, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin1Q9JKF6 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nectin1Q9JKF6 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nectin1Q9JKF6 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nectin1Q9JKF6 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nectin1Q9JKF6 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nectin1Q9JKF6 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nectin1Q9JKF6 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nectin1Q9JKF6 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nectin1Q9JKF6 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nectin1Q9JKF6 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nectin1Q9JKF6 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nectin1Q9JKF6 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nectin1Q9JKF6 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nectin1Q9JKF6 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nectin1Q9JKF6 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nectin1Q9JKF6 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nectin1Q9JKF6 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nectin1Q9JKF6 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nectin1Q9JKF6 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nectin1Q9JKF6 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nectin1Q9JKF6 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nectin1Q9JKF6 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nectin1Q9JKF6 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nectin1Q9JKF6 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nectin1Q9JKF6 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nectin1Q9JKF6 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nectin1Q9JKF6 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nectin1Q9JKF6 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nectin1Q9JKF6 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nectin1Q9JKF6 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nectin1Q9JKF6 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nectin1Q9JKF6 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nectin1Q9JKF6 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nectin1Q9JKF6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nectin1Q9JKF6 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nectin1Q9JKF6 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nectin1Q9JKF6 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Nectin1Q9JKF6 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nectin1Q9JKF6 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nectin1Q9JKF6 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nectin1Q9JKF6 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nectin1Q9JKF6 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nectin1Q9JKF6 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nectin1Q9JKF6 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nectin1Q9JKF6 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nectin1Q9JKF6 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nectin1Q9JKF6 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nectin1Q9JKF6 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nectin1Q9JKF6 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nectin1Q9JKF6 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nectin1Q9JKF6 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nectin1Q9JKF6 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Nectin1Q9JKF6 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nectin1Q9JKF6 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nectin1Q9JKF6 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nectin1Q9JKF6 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nectin1Q9JKF6 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nectin1Q9JKF6 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nectin1Q9JKF6 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nectin1Q9JKF6 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nectin1Q9JKF6 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nectin1Q9JKF6 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nectin1Q9JKF6 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nectin1Q9JKF6 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nectin1Q9JKF6 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nectin1Q9JKF6 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nectin1Q9JKF6 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nectin1Q9JKF6 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nectin1Q9JKF6 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nectin1Q9JKF6 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nectin1Q9JKF6 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nectin1Q9JKF6 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nectin1Q9JKF6 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nectin1Q9JKF6 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nectin1Q9JKF6 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nectin1Q9JKF6 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nectin1Q9JKF6 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nectin1Q9JKF6 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Nectin1Q9JKF6 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nectin1Q9JKF6 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Nectin1Q9JKF6 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nectin1Q9JKF6 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nectin1Q9JKF6 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nectin1Q9JKF6 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nectin1Q9JKF6 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nectin1Q9JKF6 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nectin1Q9JKF6 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nectin1Q9JKF6 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nectin1Q9JKF6 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nectin1Q9JKF6 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nectin1Q9JKF6 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nectin1Q9JKF6 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nectin1Q9JKF6 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nectin1Q9JKF6 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nectin1Q9JKF6 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nectin1Q9JKF6 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nectin1Q9JKF6 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nectin1Q9JKF6 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Nectin1Q9JKF6 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nectin1Q9JKF6 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms