Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE2

Trem1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem1Q9JKE2 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trem1Q9JKE2 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trem1Q9JKE2 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trem1Q9JKE2 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trem1Q9JKE2 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trem1Q9JKE2 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trem1Q9JKE2 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trem1Q9JKE2 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trem1Q9JKE2 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trem1Q9JKE2 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trem1Q9JKE2 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trem1Q9JKE2 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trem1Q9JKE2 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trem1Q9JKE2 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trem1Q9JKE2 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trem1Q9JKE2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Trem1Q9JKE2 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trem1Q9JKE2 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trem1Q9JKE2 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trem1Q9JKE2 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trem1Q9JKE2 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trem1Q9JKE2 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trem1Q9JKE2 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trem1Q9JKE2 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trem1Q9JKE2 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trem1Q9JKE2 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trem1Q9JKE2 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trem1Q9JKE2 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trem1Q9JKE2 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trem1Q9JKE2 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trem1Q9JKE2 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trem1Q9JKE2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trem1Q9JKE2 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trem1Q9JKE2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trem1Q9JKE2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trem1Q9JKE2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trem1Q9JKE2 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trem1Q9JKE2 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trem1Q9JKE2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trem1Q9JKE2 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trem1Q9JKE2 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trem1Q9JKE2 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trem1Q9JKE2 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trem1Q9JKE2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Trem1Q9JKE2 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trem1Q9JKE2 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trem1Q9JKE2 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trem1Q9JKE2 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trem1Q9JKE2 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trem1Q9JKE2 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trem1Q9JKE2 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trem1Q9JKE2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trem1Q9JKE2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trem1Q9JKE2 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trem1Q9JKE2 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trem1Q9JKE2 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trem1Q9JKE2 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trem1Q9JKE2 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trem1Q9JKE2 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trem1Q9JKE2 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trem1Q9JKE2 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trem1Q9JKE2 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trem1Q9JKE2 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trem1Q9JKE2 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trem1Q9JKE2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trem1Q9JKE2 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trem1Q9JKE2 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Trem1Q9JKE2 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trem1Q9JKE2 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trem1Q9JKE2 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trem1Q9JKE2 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trem1Q9JKE2 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trem1Q9JKE2 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trem1Q9JKE2 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trem1Q9JKE2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trem1Q9JKE2 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trem1Q9JKE2 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trem1Q9JKE2 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trem1Q9JKE2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trem1Q9JKE2 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trem1Q9JKE2 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trem1Q9JKE2 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trem1Q9JKE2 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trem1Q9JKE2 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trem1Q9JKE2 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trem1Q9JKE2 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trem1Q9JKE2 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trem1Q9JKE2 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trem1Q9JKE2 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trem1Q9JKE2 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trem1Q9JKE2 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trem1Q9JKE2 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trem1Q9JKE2 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trem1Q9JKE2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trem1Q9JKE2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trem1Q9JKE2 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trem1Q9JKE2 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trem1Q9JKE2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trem1Q9JKE2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Trem1Q9JKE2 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms