Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT0

Rcl1, RNA 3'-terminal phosphate cyclase-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcl1Q9JJT0 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Rcl1Q9JJT0 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rcl1Q9JJT0 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rcl1Q9JJT0 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rcl1Q9JJT0 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rcl1Q9JJT0 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rcl1Q9JJT0 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rcl1Q9JJT0 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rcl1Q9JJT0 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rcl1Q9JJT0 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rcl1Q9JJT0 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rcl1Q9JJT0 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rcl1Q9JJT0 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rcl1Q9JJT0 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rcl1Q9JJT0 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rcl1Q9JJT0 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rcl1Q9JJT0 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rcl1Q9JJT0 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rcl1Q9JJT0 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rcl1Q9JJT0 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Rcl1Q9JJT0 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rcl1Q9JJT0 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rcl1Q9JJT0 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rcl1Q9JJT0 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rcl1Q9JJT0 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rcl1Q9JJT0 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rcl1Q9JJT0 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rcl1Q9JJT0 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rcl1Q9JJT0 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rcl1Q9JJT0 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rcl1Q9JJT0 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rcl1Q9JJT0 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rcl1Q9JJT0 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rcl1Q9JJT0 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rcl1Q9JJT0 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rcl1Q9JJT0 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rcl1Q9JJT0 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rcl1Q9JJT0 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rcl1Q9JJT0 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Rcl1Q9JJT0 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Rcl1Q9JJT0 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rcl1Q9JJT0 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rcl1Q9JJT0 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rcl1Q9JJT0 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rcl1Q9JJT0 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rcl1Q9JJT0 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rcl1Q9JJT0 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rcl1Q9JJT0 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rcl1Q9JJT0 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rcl1Q9JJT0 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rcl1Q9JJT0 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rcl1Q9JJT0 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rcl1Q9JJT0 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rcl1Q9JJT0 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Rcl1Q9JJT0 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rcl1Q9JJT0 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rcl1Q9JJT0 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rcl1Q9JJT0 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rcl1Q9JJT0 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rcl1Q9JJT0 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Rcl1Q9JJT0 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rcl1Q9JJT0 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rcl1Q9JJT0 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rcl1Q9JJT0 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rcl1Q9JJT0 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rcl1Q9JJT0 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rcl1Q9JJT0 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rcl1Q9JJT0 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rcl1Q9JJT0 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rcl1Q9JJT0 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rcl1Q9JJT0 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rcl1Q9JJT0 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rcl1Q9JJT0 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rcl1Q9JJT0 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rcl1Q9JJT0 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rcl1Q9JJT0 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rcl1Q9JJT0 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rcl1Q9JJT0 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rcl1Q9JJT0 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rcl1Q9JJT0 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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