Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER73

Elp4, Elongator complex protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elp4Q9ER73 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Elp4Q9ER73 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Elp4Q9ER73 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Elp4Q9ER73 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Elp4Q9ER73 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Elp4Q9ER73 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Elp4Q9ER73 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Elp4Q9ER73 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Elp4Q9ER73 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Elp4Q9ER73 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Elp4Q9ER73 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Elp4Q9ER73 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Elp4Q9ER73 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Elp4Q9ER73 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Elp4Q9ER73 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Elp4Q9ER73 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Elp4Q9ER73 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Elp4Q9ER73 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Elp4Q9ER73 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Elp4Q9ER73 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Elp4Q9ER73 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Elp4Q9ER73 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Elp4Q9ER73 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Elp4Q9ER73 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Elp4Q9ER73 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Elp4Q9ER73 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Elp4Q9ER73 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Elp4Q9ER73 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Elp4Q9ER73 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Elp4Q9ER73 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Elp4Q9ER73 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Elp4Q9ER73 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Elp4Q9ER73 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Elp4Q9ER73 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Elp4Q9ER73 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Elp4Q9ER73 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Elp4Q9ER73 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Elp4Q9ER73 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Elp4Q9ER73 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Elp4Q9ER73 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Elp4Q9ER73 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Elp4Q9ER73 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Elp4Q9ER73 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Elp4Q9ER73 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Elp4Q9ER73 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Elp4Q9ER73 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Elp4Q9ER73 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Elp4Q9ER73 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Elp4Q9ER73 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Elp4Q9ER73 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Elp4Q9ER73 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Elp4Q9ER73 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Elp4Q9ER73 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Elp4Q9ER73 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Elp4Q9ER73 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Elp4Q9ER73 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Elp4Q9ER73 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Elp4Q9ER73 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Elp4Q9ER73 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Elp4Q9ER73 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Elp4Q9ER73 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Elp4Q9ER73 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Elp4Q9ER73 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Elp4Q9ER73 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Elp4Q9ER73 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Elp4Q9ER73 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Elp4Q9ER73 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Elp4Q9ER73 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Elp4Q9ER73 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Elp4Q9ER73 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Elp4Q9ER73 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Elp4Q9ER73 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Elp4Q9ER73 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Elp4Q9ER73 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Elp4Q9ER73 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Elp4Q9ER73 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Elp4Q9ER73 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Elp4Q9ER73 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Elp4Q9ER73 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Elp4Q9ER73 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Elp4Q9ER73 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Elp4Q9ER73 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Elp4Q9ER73 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Elp4Q9ER73 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Elp4Q9ER73 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Elp4Q9ER73 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Elp4Q9ER73 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Elp4Q9ER73 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Elp4Q9ER73 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Elp4Q9ER73 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Elp4Q9ER73 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Elp4Q9ER73 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Elp4Q9ER73 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Elp4Q9ER73 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Elp4Q9ER73 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Elp4Q9ER73 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Elp4Q9ER73 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Elp4Q9ER73 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Elp4Q9ER73 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Elp4Q9ER73 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms