Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rpgrip1Q9EPQ2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Rpgrip1Q9EPQ2 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rpgrip1Q9EPQ2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rpgrip1Q9EPQ2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Rpgrip1Q9EPQ2 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Rpgrip1Q9EPQ2 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Rpgrip1Q9EPQ2 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Rpgrip1Q9EPQ2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rpgrip1Q9EPQ2 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rpgrip1Q9EPQ2 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rpgrip1Q9EPQ2 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rpgrip1Q9EPQ2 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rpgrip1Q9EPQ2 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Rpgrip1Q9EPQ2 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rpgrip1Q9EPQ2 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rpgrip1Q9EPQ2 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rpgrip1Q9EPQ2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rpgrip1Q9EPQ2 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rpgrip1Q9EPQ2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rpgrip1Q9EPQ2 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rpgrip1Q9EPQ2 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rpgrip1Q9EPQ2 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rpgrip1Q9EPQ2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Rpgrip1Q9EPQ2 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rpgrip1Q9EPQ2 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rpgrip1Q9EPQ2 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rpgrip1Q9EPQ2 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rpgrip1Q9EPQ2 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rpgrip1Q9EPQ2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rpgrip1Q9EPQ2 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rpgrip1Q9EPQ2 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rpgrip1Q9EPQ2 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rpgrip1Q9EPQ2 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rpgrip1Q9EPQ2 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rpgrip1Q9EPQ2 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rpgrip1Q9EPQ2 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rpgrip1Q9EPQ2 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rpgrip1Q9EPQ2 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rpgrip1Q9EPQ2 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rpgrip1Q9EPQ2 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rpgrip1Q9EPQ2 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rpgrip1Q9EPQ2 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rpgrip1Q9EPQ2 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rpgrip1Q9EPQ2 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rpgrip1Q9EPQ2 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rpgrip1Q9EPQ2 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rpgrip1Q9EPQ2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rpgrip1Q9EPQ2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rpgrip1Q9EPQ2 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rpgrip1Q9EPQ2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rpgrip1Q9EPQ2 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rpgrip1Q9EPQ2 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Rpgrip1Q9EPQ2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms