Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hmg20aQ9DC33 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hmg20aQ9DC33 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hmg20aQ9DC33 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Hmg20aQ9DC33 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hmg20aQ9DC33 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Hmg20aQ9DC33 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Hmg20aQ9DC33 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hmg20aQ9DC33 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hmg20aQ9DC33 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hmg20aQ9DC33 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hmg20aQ9DC33 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hmg20aQ9DC33 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hmg20aQ9DC33 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hmg20aQ9DC33 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hmg20aQ9DC33 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hmg20aQ9DC33 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Hmg20aQ9DC33 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hmg20aQ9DC33 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hmg20aQ9DC33 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hmg20aQ9DC33 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Hmg20aQ9DC33 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hmg20aQ9DC33 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hmg20aQ9DC33 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hmg20aQ9DC33 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hmg20aQ9DC33 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hmg20aQ9DC33 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hmg20aQ9DC33 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hmg20aQ9DC33 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hmg20aQ9DC33 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hmg20aQ9DC33 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hmg20aQ9DC33 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hmg20aQ9DC33 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hmg20aQ9DC33 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hmg20aQ9DC33 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hmg20aQ9DC33 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hmg20aQ9DC33 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hmg20aQ9DC33 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Hmg20aQ9DC33 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hmg20aQ9DC33 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hmg20aQ9DC33 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hmg20aQ9DC33 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hmg20aQ9DC33 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hmg20aQ9DC33 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hmg20aQ9DC33 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hmg20aQ9DC33 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hmg20aQ9DC33 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hmg20aQ9DC33 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hmg20aQ9DC33 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hmg20aQ9DC33 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hmg20aQ9DC33 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hmg20aQ9DC33 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hmg20aQ9DC33 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hmg20aQ9DC33 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hmg20aQ9DC33 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hmg20aQ9DC33 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hmg20aQ9DC33 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Hmg20aQ9DC33 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hmg20aQ9DC33 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hmg20aQ9DC33 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hmg20aQ9DC33 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hmg20aQ9DC33 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hmg20aQ9DC33 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hmg20aQ9DC33 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hmg20aQ9DC33 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hmg20aQ9DC33 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmg20aQ9DC33 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmg20aQ9DC33 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmg20aQ9DC33 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmg20aQ9DC33 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmg20aQ9DC33 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmg20aQ9DC33 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmg20aQ9DC33 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmg20aQ9DC33 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmg20aQ9DC33 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmg20aQ9DC33 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmg20aQ9DC33 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmg20aQ9DC33 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmg20aQ9DC33 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmg20aQ9DC33 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmg20aQ9DC33 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmg20aQ9DC33 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmg20aQ9DC33 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hmg20aQ9DC33 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hmg20aQ9DC33 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hmg20aQ9DC33 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hmg20aQ9DC33 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hmg20aQ9DC33 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hmg20aQ9DC33 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hmg20aQ9DC33 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hmg20aQ9DC33 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Hmg20aQ9DC33 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hmg20aQ9DC33 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hmg20aQ9DC33 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hmg20aQ9DC33 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hmg20aQ9DC33 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hmg20aQ9DC33 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hmg20aQ9DC33 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hmg20aQ9DC33 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hmg20aQ9DC33 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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