Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAK3

Rhobtb1, Rho-related BTB domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb1Q9DAK3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rhobtb1Q9DAK3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rhobtb1Q9DAK3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Rhobtb1Q9DAK3 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rhobtb1Q9DAK3 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Rhobtb1Q9DAK3 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Rhobtb1Q9DAK3 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Rhobtb1Q9DAK3 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Rhobtb1Q9DAK3 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Rhobtb1Q9DAK3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Rhobtb1Q9DAK3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rhobtb1Q9DAK3 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rhobtb1Q9DAK3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rhobtb1Q9DAK3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rhobtb1Q9DAK3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rhobtb1Q9DAK3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rhobtb1Q9DAK3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rhobtb1Q9DAK3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rhobtb1Q9DAK3 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rhobtb1Q9DAK3 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rhobtb1Q9DAK3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rhobtb1Q9DAK3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rhobtb1Q9DAK3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rhobtb1Q9DAK3 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rhobtb1Q9DAK3 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rhobtb1Q9DAK3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rhobtb1Q9DAK3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rhobtb1Q9DAK3 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rhobtb1Q9DAK3 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rhobtb1Q9DAK3 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rhobtb1Q9DAK3 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rhobtb1Q9DAK3 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rhobtb1Q9DAK3 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rhobtb1Q9DAK3 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rhobtb1Q9DAK3 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rhobtb1Q9DAK3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rhobtb1Q9DAK3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rhobtb1Q9DAK3 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rhobtb1Q9DAK3 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rhobtb1Q9DAK3 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rhobtb1Q9DAK3 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rhobtb1Q9DAK3 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rhobtb1Q9DAK3 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rhobtb1Q9DAK3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rhobtb1Q9DAK3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rhobtb1Q9DAK3 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rhobtb1Q9DAK3 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Rhobtb1Q9DAK3 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Rhobtb1Q9DAK3 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rhobtb1Q9DAK3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rhobtb1Q9DAK3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rhobtb1Q9DAK3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rhobtb1Q9DAK3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rhobtb1Q9DAK3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rhobtb1Q9DAK3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rhobtb1Q9DAK3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rhobtb1Q9DAK3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rhobtb1Q9DAK3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rhobtb1Q9DAK3 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rhobtb1Q9DAK3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rhobtb1Q9DAK3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rhobtb1Q9DAK3 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rhobtb1Q9DAK3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rhobtb1Q9DAK3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rhobtb1Q9DAK3 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rhobtb1Q9DAK3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rhobtb1Q9DAK3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rhobtb1Q9DAK3 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rhobtb1Q9DAK3 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rhobtb1Q9DAK3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rhobtb1Q9DAK3 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rhobtb1Q9DAK3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rhobtb1Q9DAK3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rhobtb1Q9DAK3 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rhobtb1Q9DAK3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rhobtb1Q9DAK3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rhobtb1Q9DAK3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rhobtb1Q9DAK3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rhobtb1Q9DAK3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rhobtb1Q9DAK3 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rhobtb1Q9DAK3 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Rhobtb1Q9DAK3 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rhobtb1Q9DAK3 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rhobtb1Q9DAK3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rhobtb1Q9DAK3 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rhobtb1Q9DAK3 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rhobtb1Q9DAK3 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rhobtb1Q9DAK3 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rhobtb1Q9DAK3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rhobtb1Q9DAK3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rhobtb1Q9DAK3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rhobtb1Q9DAK3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rhobtb1Q9DAK3 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rhobtb1Q9DAK3 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rhobtb1Q9DAK3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rhobtb1Q9DAK3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rhobtb1Q9DAK3 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rhobtb1Q9DAK3 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rhobtb1Q9DAK3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rhobtb1Q9DAK3 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms