Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp12Q9D9M2 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp12Q9D9M2 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp12Q9D9M2 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp12Q9D9M2 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp12Q9D9M2 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp12Q9D9M2 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp12Q9D9M2 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp12Q9D9M2 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp12Q9D9M2 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp12Q9D9M2 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp12Q9D9M2 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp12Q9D9M2 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp12Q9D9M2 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp12Q9D9M2 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp12Q9D9M2 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp12Q9D9M2 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp12Q9D9M2 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp12Q9D9M2 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp12Q9D9M2 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp12Q9D9M2 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp12Q9D9M2 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp12Q9D9M2 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp12Q9D9M2 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp12Q9D9M2 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp12Q9D9M2 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp12Q9D9M2 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp12Q9D9M2 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp12Q9D9M2 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp12Q9D9M2 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp12Q9D9M2 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp12Q9D9M2 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp12Q9D9M2 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp12Q9D9M2 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp12Q9D9M2 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp12Q9D9M2 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp12Q9D9M2 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp12Q9D9M2 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp12Q9D9M2 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp12Q9D9M2 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp12Q9D9M2 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp12Q9D9M2 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp12Q9D9M2 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp12Q9D9M2 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp12Q9D9M2 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp12Q9D9M2 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp12Q9D9M2 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp12Q9D9M2 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp12Q9D9M2 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp12Q9D9M2 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp12Q9D9M2 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp12Q9D9M2 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp12Q9D9M2 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp12Q9D9M2 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp12Q9D9M2 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp12Q9D9M2 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp12Q9D9M2 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp12Q9D9M2 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp12Q9D9M2 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp12Q9D9M2 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp12Q9D9M2 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp12Q9D9M2 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp12Q9D9M2 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp12Q9D9M2 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp12Q9D9M2 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp12Q9D9M2 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp12Q9D9M2 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp12Q9D9M2 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp12Q9D9M2 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp12Q9D9M2 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp12Q9D9M2 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp12Q9D9M2 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp12Q9D9M2 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp12Q9D9M2 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp12Q9D9M2 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp12Q9D9M2 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp12Q9D9M2 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp12Q9D9M2 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp12Q9D9M2 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp12Q9D9M2 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp12Q9D9M2 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp12Q9D9M2 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp12Q9D9M2 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp12Q9D9M2 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp12Q9D9M2 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp12Q9D9M2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp12Q9D9M2 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp12Q9D9M2 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp12Q9D9M2 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp12Q9D9M2 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp12Q9D9M2 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp12Q9D9M2 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp12Q9D9M2 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp12Q9D9M2 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp12Q9D9M2 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp12Q9D9M2 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp12Q9D9M2 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp12Q9D9M2 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp12Q9D9M2 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp12Q9D9M2 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms