Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y1

Ccdc3, Coiled-coil domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc3Q9D6Y1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc3Q9D6Y1 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc3Q9D6Y1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc3Q9D6Y1 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc3Q9D6Y1 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc3Q9D6Y1 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc3Q9D6Y1 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc3Q9D6Y1 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc3Q9D6Y1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc3Q9D6Y1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc3Q9D6Y1 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc3Q9D6Y1 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc3Q9D6Y1 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc3Q9D6Y1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc3Q9D6Y1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc3Q9D6Y1 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc3Q9D6Y1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc3Q9D6Y1 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc3Q9D6Y1 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc3Q9D6Y1 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc3Q9D6Y1 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc3Q9D6Y1 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc3Q9D6Y1 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc3Q9D6Y1 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc3Q9D6Y1 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc3Q9D6Y1 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc3Q9D6Y1 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc3Q9D6Y1 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc3Q9D6Y1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc3Q9D6Y1 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc3Q9D6Y1 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc3Q9D6Y1 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc3Q9D6Y1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc3Q9D6Y1 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc3Q9D6Y1 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc3Q9D6Y1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc3Q9D6Y1 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc3Q9D6Y1 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc3Q9D6Y1 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc3Q9D6Y1 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc3Q9D6Y1 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc3Q9D6Y1 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc3Q9D6Y1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc3Q9D6Y1 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc3Q9D6Y1 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc3Q9D6Y1 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ccdc3Q9D6Y1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc3Q9D6Y1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc3Q9D6Y1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc3Q9D6Y1 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc3Q9D6Y1 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc3Q9D6Y1 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc3Q9D6Y1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc3Q9D6Y1 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc3Q9D6Y1 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc3Q9D6Y1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc3Q9D6Y1 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc3Q9D6Y1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc3Q9D6Y1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc3Q9D6Y1 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc3Q9D6Y1 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc3Q9D6Y1 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc3Q9D6Y1 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc3Q9D6Y1 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc3Q9D6Y1 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc3Q9D6Y1 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc3Q9D6Y1 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc3Q9D6Y1 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc3Q9D6Y1 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc3Q9D6Y1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc3Q9D6Y1 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc3Q9D6Y1 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc3Q9D6Y1 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc3Q9D6Y1 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc3Q9D6Y1 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc3Q9D6Y1 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc3Q9D6Y1 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc3Q9D6Y1 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc3Q9D6Y1 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc3Q9D6Y1 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc3Q9D6Y1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc3Q9D6Y1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc3Q9D6Y1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc3Q9D6Y1 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc3Q9D6Y1 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc3Q9D6Y1 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc3Q9D6Y1 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc3Q9D6Y1 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc3Q9D6Y1 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc3Q9D6Y1 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc3Q9D6Y1 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc3Q9D6Y1 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc3Q9D6Y1 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc3Q9D6Y1 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc3Q9D6Y1 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc3Q9D6Y1 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc3Q9D6Y1 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc3Q9D6Y1 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc3Q9D6Y1 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc3Q9D6Y1 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms