Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PudpQ9D5U5 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PudpQ9D5U5 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PudpQ9D5U5 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PudpQ9D5U5 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PudpQ9D5U5 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PudpQ9D5U5 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PudpQ9D5U5 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PudpQ9D5U5 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PudpQ9D5U5 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PudpQ9D5U5 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PudpQ9D5U5 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PudpQ9D5U5 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PudpQ9D5U5 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PudpQ9D5U5 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PudpQ9D5U5 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PudpQ9D5U5 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PudpQ9D5U5 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PudpQ9D5U5 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PudpQ9D5U5 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PudpQ9D5U5 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PudpQ9D5U5 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PudpQ9D5U5 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PudpQ9D5U5 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PudpQ9D5U5 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PudpQ9D5U5 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PudpQ9D5U5 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PudpQ9D5U5 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PudpQ9D5U5 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PudpQ9D5U5 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PudpQ9D5U5 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PudpQ9D5U5 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PudpQ9D5U5 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PudpQ9D5U5 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PudpQ9D5U5 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PudpQ9D5U5 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PudpQ9D5U5 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PudpQ9D5U5 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PudpQ9D5U5 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PudpQ9D5U5 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PudpQ9D5U5 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PudpQ9D5U5 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PudpQ9D5U5 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PudpQ9D5U5 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PudpQ9D5U5 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PudpQ9D5U5 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PudpQ9D5U5 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PudpQ9D5U5 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PudpQ9D5U5 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PudpQ9D5U5 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PudpQ9D5U5 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PudpQ9D5U5 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PudpQ9D5U5 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PudpQ9D5U5 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PudpQ9D5U5 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PudpQ9D5U5 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PudpQ9D5U5 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PudpQ9D5U5 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PudpQ9D5U5 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PudpQ9D5U5 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PudpQ9D5U5 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PudpQ9D5U5 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PudpQ9D5U5 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PudpQ9D5U5 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PudpQ9D5U5 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PudpQ9D5U5 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PudpQ9D5U5 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PudpQ9D5U5 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PudpQ9D5U5 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PudpQ9D5U5 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PudpQ9D5U5 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PudpQ9D5U5 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PudpQ9D5U5 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PudpQ9D5U5 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PudpQ9D5U5 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PudpQ9D5U5 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PudpQ9D5U5 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PudpQ9D5U5 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PudpQ9D5U5 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PudpQ9D5U5 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PudpQ9D5U5 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PudpQ9D5U5 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PudpQ9D5U5 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PudpQ9D5U5 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PudpQ9D5U5 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PudpQ9D5U5 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PudpQ9D5U5 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PudpQ9D5U5 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PudpQ9D5U5 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PudpQ9D5U5 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PudpQ9D5U5 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PudpQ9D5U5 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PudpQ9D5U5 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PudpQ9D5U5 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PudpQ9D5U5 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PudpQ9D5U5 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PudpQ9D5U5 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PudpQ9D5U5 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PudpQ9D5U5 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PudpQ9D5U5 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms