Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5J6

Shpk, Sedoheptulokinase, mousemouse

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Length 476 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ShpkQ9D5J6 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ShpkQ9D5J6 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ShpkQ9D5J6 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ShpkQ9D5J6 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ShpkQ9D5J6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ShpkQ9D5J6 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ShpkQ9D5J6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ShpkQ9D5J6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ShpkQ9D5J6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ShpkQ9D5J6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ShpkQ9D5J6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ShpkQ9D5J6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ShpkQ9D5J6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ShpkQ9D5J6 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ShpkQ9D5J6 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ShpkQ9D5J6 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ShpkQ9D5J6 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ShpkQ9D5J6 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ShpkQ9D5J6 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ShpkQ9D5J6 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ShpkQ9D5J6 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ShpkQ9D5J6 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ShpkQ9D5J6 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ShpkQ9D5J6 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ShpkQ9D5J6 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ShpkQ9D5J6 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ShpkQ9D5J6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ShpkQ9D5J6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ShpkQ9D5J6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ShpkQ9D5J6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ShpkQ9D5J6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ShpkQ9D5J6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ShpkQ9D5J6 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ShpkQ9D5J6 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ShpkQ9D5J6 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ShpkQ9D5J6 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ShpkQ9D5J6 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ShpkQ9D5J6 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ShpkQ9D5J6 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ShpkQ9D5J6 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ShpkQ9D5J6 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ShpkQ9D5J6 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ShpkQ9D5J6 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ShpkQ9D5J6 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ShpkQ9D5J6 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ShpkQ9D5J6 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ShpkQ9D5J6 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ShpkQ9D5J6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ShpkQ9D5J6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ShpkQ9D5J6 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ShpkQ9D5J6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ShpkQ9D5J6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ShpkQ9D5J6 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ShpkQ9D5J6 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ShpkQ9D5J6 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ShpkQ9D5J6 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ShpkQ9D5J6 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ShpkQ9D5J6 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ShpkQ9D5J6 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ShpkQ9D5J6 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ShpkQ9D5J6 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ShpkQ9D5J6 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ShpkQ9D5J6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ShpkQ9D5J6 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ShpkQ9D5J6 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ShpkQ9D5J6 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ShpkQ9D5J6 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ShpkQ9D5J6 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ShpkQ9D5J6 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ShpkQ9D5J6 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ShpkQ9D5J6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ShpkQ9D5J6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ShpkQ9D5J6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ShpkQ9D5J6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ShpkQ9D5J6 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ShpkQ9D5J6 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ShpkQ9D5J6 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ShpkQ9D5J6 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ShpkQ9D5J6 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ShpkQ9D5J6 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ShpkQ9D5J6 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ShpkQ9D5J6 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ShpkQ9D5J6 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ShpkQ9D5J6 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ShpkQ9D5J6 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ShpkQ9D5J6 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
ShpkQ9D5J6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ShpkQ9D5J6 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ShpkQ9D5J6 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ShpkQ9D5J6 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ShpkQ9D5J6 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ShpkQ9D5J6 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ShpkQ9D5J6 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ShpkQ9D5J6 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ShpkQ9D5J6 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ShpkQ9D5J6 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ShpkQ9D5J6 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ShpkQ9D5J6 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ShpkQ9D5J6 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ShpkQ9D5J6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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