Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4U4

H2al3, H2A histone family member L3, mousemouse

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Length 128 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al3Q9D4U4 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2al3Q9D4U4 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
H2al3Q9D4U4 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
H2al3Q9D4U4 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2al3Q9D4U4 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2al3Q9D4U4 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2al3Q9D4U4 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2al3Q9D4U4 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2al3Q9D4U4 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2al3Q9D4U4 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2al3Q9D4U4 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2al3Q9D4U4 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2al3Q9D4U4 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2al3Q9D4U4 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2al3Q9D4U4 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2al3Q9D4U4 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2al3Q9D4U4 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
H2al3Q9D4U4 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2al3Q9D4U4 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2al3Q9D4U4 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2al3Q9D4U4 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2al3Q9D4U4 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2al3Q9D4U4 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2al3Q9D4U4 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2al3Q9D4U4 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2al3Q9D4U4 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2al3Q9D4U4 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2al3Q9D4U4 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
H2al3Q9D4U4 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
H2al3Q9D4U4 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2al3Q9D4U4 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2al3Q9D4U4 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2al3Q9D4U4 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2al3Q9D4U4 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2al3Q9D4U4 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2al3Q9D4U4 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
H2al3Q9D4U4 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2al3Q9D4U4 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2al3Q9D4U4 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2al3Q9D4U4 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2al3Q9D4U4 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2al3Q9D4U4 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2al3Q9D4U4 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2al3Q9D4U4 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2al3Q9D4U4 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2al3Q9D4U4 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
H2al3Q9D4U4 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
H2al3Q9D4U4 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
H2al3Q9D4U4 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2al3Q9D4U4 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2al3Q9D4U4 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2al3Q9D4U4 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2al3Q9D4U4 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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H2al3Q9D4U4 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2al3Q9D4U4 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2al3Q9D4U4 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2al3Q9D4U4 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2al3Q9D4U4 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
H2al3Q9D4U4 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2al3Q9D4U4 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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H2al3Q9D4U4 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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H2al3Q9D4U4 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2al3Q9D4U4 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2al3Q9D4U4 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2al3Q9D4U4 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2al3Q9D4U4 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2al3Q9D4U4 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2al3Q9D4U4 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2al3Q9D4U4 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
H2al3Q9D4U4 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2al3Q9D4U4 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2al3Q9D4U4 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2al3Q9D4U4 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2al3Q9D4U4 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2al3Q9D4U4 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2al3Q9D4U4 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2al3Q9D4U4 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2al3Q9D4U4 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2al3Q9D4U4 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2al3Q9D4U4 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2al3Q9D4U4 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2al3Q9D4U4 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2al3Q9D4U4 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2al3Q9D4U4 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2al3Q9D4U4 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2al3Q9D4U4 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2al3Q9D4U4 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2al3Q9D4U4 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2al3Q9D4U4 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2al3Q9D4U4 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2al3Q9D4U4 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2al3Q9D4U4 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2al3Q9D4U4 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2al3Q9D4U4 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2al3Q9D4U4 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2al3Q9D4U4 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2al3Q9D4U4 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms