Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F8

Tubgcp4, Gamma-tubulin complex component 4, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp4Q9D4F8 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tubgcp4Q9D4F8 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tubgcp4Q9D4F8 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tubgcp4Q9D4F8 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tubgcp4Q9D4F8 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tubgcp4Q9D4F8 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tubgcp4Q9D4F8 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tubgcp4Q9D4F8 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tubgcp4Q9D4F8 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tubgcp4Q9D4F8 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tubgcp4Q9D4F8 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tubgcp4Q9D4F8 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tubgcp4Q9D4F8 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Tubgcp4Q9D4F8 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tubgcp4Q9D4F8 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tubgcp4Q9D4F8 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tubgcp4Q9D4F8 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tubgcp4Q9D4F8 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tubgcp4Q9D4F8 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tubgcp4Q9D4F8 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tubgcp4Q9D4F8 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tubgcp4Q9D4F8 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Tubgcp4Q9D4F8 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Tubgcp4Q9D4F8 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tubgcp4Q9D4F8 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tubgcp4Q9D4F8 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tubgcp4Q9D4F8 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tubgcp4Q9D4F8 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tubgcp4Q9D4F8 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tubgcp4Q9D4F8 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tubgcp4Q9D4F8 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tubgcp4Q9D4F8 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tubgcp4Q9D4F8 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tubgcp4Q9D4F8 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tubgcp4Q9D4F8 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tubgcp4Q9D4F8 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tubgcp4Q9D4F8 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tubgcp4Q9D4F8 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tubgcp4Q9D4F8 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tubgcp4Q9D4F8 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tubgcp4Q9D4F8 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tubgcp4Q9D4F8 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tubgcp4Q9D4F8 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tubgcp4Q9D4F8 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tubgcp4Q9D4F8 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tubgcp4Q9D4F8 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tubgcp4Q9D4F8 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tubgcp4Q9D4F8 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tubgcp4Q9D4F8 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tubgcp4Q9D4F8 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tubgcp4Q9D4F8 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tubgcp4Q9D4F8 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tubgcp4Q9D4F8 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tubgcp4Q9D4F8 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Tubgcp4Q9D4F8 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tubgcp4Q9D4F8 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tubgcp4Q9D4F8 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tubgcp4Q9D4F8 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tubgcp4Q9D4F8 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tubgcp4Q9D4F8 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tubgcp4Q9D4F8 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tubgcp4Q9D4F8 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tubgcp4Q9D4F8 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tubgcp4Q9D4F8 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tubgcp4Q9D4F8 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tubgcp4Q9D4F8 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Tubgcp4Q9D4F8 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tubgcp4Q9D4F8 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tubgcp4Q9D4F8 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tubgcp4Q9D4F8 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tubgcp4Q9D4F8 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tubgcp4Q9D4F8 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Tubgcp4Q9D4F8 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tubgcp4Q9D4F8 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tubgcp4Q9D4F8 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tubgcp4Q9D4F8 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tubgcp4Q9D4F8 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tubgcp4Q9D4F8 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tubgcp4Q9D4F8 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tubgcp4Q9D4F8 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tubgcp4Q9D4F8 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tubgcp4Q9D4F8 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tubgcp4Q9D4F8 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tubgcp4Q9D4F8 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tubgcp4Q9D4F8 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tubgcp4Q9D4F8 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tubgcp4Q9D4F8 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tubgcp4Q9D4F8 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tubgcp4Q9D4F8 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tubgcp4Q9D4F8 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tubgcp4Q9D4F8 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tubgcp4Q9D4F8 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tubgcp4Q9D4F8 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tubgcp4Q9D4F8 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Tubgcp4Q9D4F8 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Tubgcp4Q9D4F8 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms