Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C1

Lmntd1, Lamin tail domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmntd1Q9D4C1 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmntd1Q9D4C1 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmntd1Q9D4C1 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmntd1Q9D4C1 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmntd1Q9D4C1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmntd1Q9D4C1 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmntd1Q9D4C1 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lmntd1Q9D4C1 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lmntd1Q9D4C1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lmntd1Q9D4C1 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lmntd1Q9D4C1 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Lmntd1Q9D4C1 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Lmntd1Q9D4C1 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lmntd1Q9D4C1 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lmntd1Q9D4C1 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lmntd1Q9D4C1 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lmntd1Q9D4C1 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lmntd1Q9D4C1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lmntd1Q9D4C1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lmntd1Q9D4C1 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lmntd1Q9D4C1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lmntd1Q9D4C1 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmntd1Q9D4C1 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmntd1Q9D4C1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmntd1Q9D4C1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmntd1Q9D4C1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmntd1Q9D4C1 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmntd1Q9D4C1 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmntd1Q9D4C1 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmntd1Q9D4C1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmntd1Q9D4C1 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmntd1Q9D4C1 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmntd1Q9D4C1 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmntd1Q9D4C1 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmntd1Q9D4C1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmntd1Q9D4C1 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmntd1Q9D4C1 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmntd1Q9D4C1 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmntd1Q9D4C1 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmntd1Q9D4C1 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmntd1Q9D4C1 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmntd1Q9D4C1 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmntd1Q9D4C1 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmntd1Q9D4C1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmntd1Q9D4C1 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmntd1Q9D4C1 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmntd1Q9D4C1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmntd1Q9D4C1 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmntd1Q9D4C1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmntd1Q9D4C1 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmntd1Q9D4C1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmntd1Q9D4C1 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmntd1Q9D4C1 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmntd1Q9D4C1 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmntd1Q9D4C1 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmntd1Q9D4C1 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmntd1Q9D4C1 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmntd1Q9D4C1 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmntd1Q9D4C1 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmntd1Q9D4C1 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmntd1Q9D4C1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmntd1Q9D4C1 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmntd1Q9D4C1 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmntd1Q9D4C1 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmntd1Q9D4C1 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmntd1Q9D4C1 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmntd1Q9D4C1 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmntd1Q9D4C1 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmntd1Q9D4C1 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmntd1Q9D4C1 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmntd1Q9D4C1 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmntd1Q9D4C1 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmntd1Q9D4C1 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmntd1Q9D4C1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmntd1Q9D4C1 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmntd1Q9D4C1 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmntd1Q9D4C1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmntd1Q9D4C1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmntd1Q9D4C1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmntd1Q9D4C1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmntd1Q9D4C1 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmntd1Q9D4C1 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmntd1Q9D4C1 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmntd1Q9D4C1 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmntd1Q9D4C1 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmntd1Q9D4C1 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmntd1Q9D4C1 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmntd1Q9D4C1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmntd1Q9D4C1 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmntd1Q9D4C1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmntd1Q9D4C1 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmntd1Q9D4C1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmntd1Q9D4C1 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmntd1Q9D4C1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmntd1Q9D4C1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmntd1Q9D4C1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmntd1Q9D4C1 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmntd1Q9D4C1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmntd1Q9D4C1 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmntd1Q9D4C1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms