Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Syce1Q9D495 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Syce1Q9D495 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Syce1Q9D495 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Syce1Q9D495 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Syce1Q9D495 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Syce1Q9D495 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Syce1Q9D495 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Syce1Q9D495 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Syce1Q9D495 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Syce1Q9D495 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Syce1Q9D495 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Syce1Q9D495 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Syce1Q9D495 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Syce1Q9D495 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Syce1Q9D495 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Syce1Q9D495 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Syce1Q9D495 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Syce1Q9D495 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Syce1Q9D495 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Syce1Q9D495 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Syce1Q9D495 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Syce1Q9D495 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Syce1Q9D495 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Syce1Q9D495 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Syce1Q9D495 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Syce1Q9D495 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Syce1Q9D495 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Syce1Q9D495 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Syce1Q9D495 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Syce1Q9D495 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Syce1Q9D495 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Syce1Q9D495 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Syce1Q9D495 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Syce1Q9D495 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Syce1Q9D495 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Syce1Q9D495 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Syce1Q9D495 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Syce1Q9D495 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Syce1Q9D495 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Syce1Q9D495 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Syce1Q9D495 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Syce1Q9D495 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Syce1Q9D495 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Syce1Q9D495 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Syce1Q9D495 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Syce1Q9D495 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Syce1Q9D495 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Syce1Q9D495 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Syce1Q9D495 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Syce1Q9D495 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Syce1Q9D495 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Syce1Q9D495 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Syce1Q9D495 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Syce1Q9D495 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Syce1Q9D495 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Syce1Q9D495 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Syce1Q9D495 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Syce1Q9D495 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Syce1Q9D495 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Syce1Q9D495 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Syce1Q9D495 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Syce1Q9D495 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Syce1Q9D495 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Syce1Q9D495 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Syce1Q9D495 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Syce1Q9D495 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Syce1Q9D495 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Syce1Q9D495 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Syce1Q9D495 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Syce1Q9D495 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Syce1Q9D495 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Syce1Q9D495 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Syce1Q9D495 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Syce1Q9D495 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Syce1Q9D495 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Syce1Q9D495 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Syce1Q9D495 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Syce1Q9D495 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Syce1Q9D495 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Syce1Q9D495 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Syce1Q9D495 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Syce1Q9D495 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Syce1Q9D495 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Syce1Q9D495 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Syce1Q9D495 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Syce1Q9D495 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Syce1Q9D495 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Syce1Q9D495 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Syce1Q9D495 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Syce1Q9D495 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Syce1Q9D495 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Syce1Q9D495 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Syce1Q9D495 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Syce1Q9D495 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Syce1Q9D495 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Syce1Q9D495 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Syce1Q9D495 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Syce1Q9D495 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Syce1Q9D495 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms