Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2R4

Tmed11, Transmembrane emp24 domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed11Q9D2R4 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Tmed11Q9D2R4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmed11Q9D2R4 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmed11Q9D2R4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmed11Q9D2R4 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Tmed11Q9D2R4 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmed11Q9D2R4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Tmed11Q9D2R4 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Tmed11Q9D2R4 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Tmed11Q9D2R4 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmed11Q9D2R4 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmed11Q9D2R4 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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Tmed11Q9D2R4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmed11Q9D2R4 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmed11Q9D2R4 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmed11Q9D2R4 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmed11Q9D2R4 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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Tmed11Q9D2R4 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmed11Q9D2R4 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
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Tmed11Q9D2R4 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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Tmed11Q9D2R4 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmed11Q9D2R4 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms