Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUN6

Smurf1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smurf1Q9CUN6 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smurf1Q9CUN6 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smurf1Q9CUN6 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smurf1Q9CUN6 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smurf1Q9CUN6 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smurf1Q9CUN6 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smurf1Q9CUN6 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smurf1Q9CUN6 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smurf1Q9CUN6 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smurf1Q9CUN6 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smurf1Q9CUN6 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smurf1Q9CUN6 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smurf1Q9CUN6 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smurf1Q9CUN6 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smurf1Q9CUN6 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smurf1Q9CUN6 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smurf1Q9CUN6 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smurf1Q9CUN6 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smurf1Q9CUN6 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smurf1Q9CUN6 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smurf1Q9CUN6 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smurf1Q9CUN6 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smurf1Q9CUN6 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smurf1Q9CUN6 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smurf1Q9CUN6 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smurf1Q9CUN6 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smurf1Q9CUN6 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smurf1Q9CUN6 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smurf1Q9CUN6 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smurf1Q9CUN6 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smurf1Q9CUN6 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smurf1Q9CUN6 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smurf1Q9CUN6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smurf1Q9CUN6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smurf1Q9CUN6 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smurf1Q9CUN6 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smurf1Q9CUN6 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smurf1Q9CUN6 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smurf1Q9CUN6 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smurf1Q9CUN6 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smurf1Q9CUN6 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smurf1Q9CUN6 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smurf1Q9CUN6 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smurf1Q9CUN6 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smurf1Q9CUN6 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smurf1Q9CUN6 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Smurf1Q9CUN6 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Smurf1Q9CUN6 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smurf1Q9CUN6 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smurf1Q9CUN6 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smurf1Q9CUN6 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smurf1Q9CUN6 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smurf1Q9CUN6 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smurf1Q9CUN6 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smurf1Q9CUN6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smurf1Q9CUN6 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smurf1Q9CUN6 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smurf1Q9CUN6 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smurf1Q9CUN6 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smurf1Q9CUN6 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smurf1Q9CUN6 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smurf1Q9CUN6 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smurf1Q9CUN6 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smurf1Q9CUN6 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smurf1Q9CUN6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smurf1Q9CUN6 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smurf1Q9CUN6 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smurf1Q9CUN6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Smurf1Q9CUN6 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smurf1Q9CUN6 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Smurf1Q9CUN6 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smurf1Q9CUN6 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smurf1Q9CUN6 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smurf1Q9CUN6 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smurf1Q9CUN6 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smurf1Q9CUN6 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smurf1Q9CUN6 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smurf1Q9CUN6 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smurf1Q9CUN6 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smurf1Q9CUN6 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smurf1Q9CUN6 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smurf1Q9CUN6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smurf1Q9CUN6 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smurf1Q9CUN6 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smurf1Q9CUN6 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smurf1Q9CUN6 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smurf1Q9CUN6 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smurf1Q9CUN6 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smurf1Q9CUN6 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smurf1Q9CUN6 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smurf1Q9CUN6 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smurf1Q9CUN6 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smurf1Q9CUN6 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smurf1Q9CUN6 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smurf1Q9CUN6 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smurf1Q9CUN6 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smurf1Q9CUN6 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smurf1Q9CUN6 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smurf1Q9CUN6 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smurf1Q9CUN6 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms