Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRW3

UPF0538 protein C2orf76 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRW3 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9CRW3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9CRW3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9CRW3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9CRW3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9CRW3 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9CRW3 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9CRW3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9CRW3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9CRW3 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9CRW3 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9CRW3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9CRW3 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9CRW3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9CRW3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9CRW3 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9CRW3 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9CRW3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9CRW3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9CRW3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9CRW3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9CRW3 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9CRW3 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9CRW3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9CRW3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9CRW3 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9CRW3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9CRW3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9CRW3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9CRW3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9CRW3 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9CRW3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9CRW3 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9CRW3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9CRW3 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9CRW3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9CRW3 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9CRW3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9CRW3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9CRW3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9CRW3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9CRW3 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9CRW3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9CRW3 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9CRW3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9CRW3 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9CRW3 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9CRW3 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9CRW3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9CRW3 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9CRW3 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9CRW3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9CRW3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9CRW3 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9CRW3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9CRW3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9CRW3 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9CRW3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9CRW3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CRW3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CRW3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CRW3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CRW3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CRW3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CRW3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CRW3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CRW3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CRW3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CRW3 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CRW3 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CRW3 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CRW3 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CRW3 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CRW3 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CRW3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CRW3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CRW3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CRW3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CRW3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CRW3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CRW3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CRW3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CRW3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CRW3 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CRW3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CRW3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CRW3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CRW3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CRW3 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CRW3 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CRW3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CRW3 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CRW3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CRW3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CRW3 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CRW3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CRW3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CRW3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CRW3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CRW3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms