Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQI7

Snrpb2, U2 small nuclear ribonucleoprotein B'', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpb2Q9CQI7 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snrpb2Q9CQI7 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snrpb2Q9CQI7 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snrpb2Q9CQI7 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snrpb2Q9CQI7 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snrpb2Q9CQI7 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snrpb2Q9CQI7 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snrpb2Q9CQI7 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snrpb2Q9CQI7 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snrpb2Q9CQI7 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snrpb2Q9CQI7 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snrpb2Q9CQI7 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snrpb2Q9CQI7 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snrpb2Q9CQI7 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snrpb2Q9CQI7 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snrpb2Q9CQI7 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snrpb2Q9CQI7 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snrpb2Q9CQI7 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Snrpb2Q9CQI7 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Snrpb2Q9CQI7 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Snrpb2Q9CQI7 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Snrpb2Q9CQI7 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Snrpb2Q9CQI7 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Snrpb2Q9CQI7 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Snrpb2Q9CQI7 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Snrpb2Q9CQI7 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Snrpb2Q9CQI7 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Snrpb2Q9CQI7 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Snrpb2Q9CQI7 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Snrpb2Q9CQI7 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Snrpb2Q9CQI7 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Snrpb2Q9CQI7 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Snrpb2Q9CQI7 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Snrpb2Q9CQI7 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Snrpb2Q9CQI7 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Snrpb2Q9CQI7 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snrpb2Q9CQI7 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snrpb2Q9CQI7 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snrpb2Q9CQI7 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snrpb2Q9CQI7 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snrpb2Q9CQI7 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snrpb2Q9CQI7 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snrpb2Q9CQI7 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snrpb2Q9CQI7 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Snrpb2Q9CQI7 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Snrpb2Q9CQI7 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snrpb2Q9CQI7 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Snrpb2Q9CQI7 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snrpb2Q9CQI7 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snrpb2Q9CQI7 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snrpb2Q9CQI7 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snrpb2Q9CQI7 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Snrpb2Q9CQI7 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snrpb2Q9CQI7 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snrpb2Q9CQI7 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snrpb2Q9CQI7 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snrpb2Q9CQI7 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snrpb2Q9CQI7 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snrpb2Q9CQI7 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snrpb2Q9CQI7 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snrpb2Q9CQI7 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snrpb2Q9CQI7 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snrpb2Q9CQI7 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snrpb2Q9CQI7 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Snrpb2Q9CQI7 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snrpb2Q9CQI7 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snrpb2Q9CQI7 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snrpb2Q9CQI7 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snrpb2Q9CQI7 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Snrpb2Q9CQI7 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snrpb2Q9CQI7 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snrpb2Q9CQI7 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snrpb2Q9CQI7 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snrpb2Q9CQI7 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snrpb2Q9CQI7 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snrpb2Q9CQI7 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snrpb2Q9CQI7 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snrpb2Q9CQI7 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snrpb2Q9CQI7 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snrpb2Q9CQI7 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snrpb2Q9CQI7 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snrpb2Q9CQI7 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snrpb2Q9CQI7 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snrpb2Q9CQI7 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snrpb2Q9CQI7 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snrpb2Q9CQI7 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snrpb2Q9CQI7 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snrpb2Q9CQI7 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snrpb2Q9CQI7 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snrpb2Q9CQI7 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Snrpb2Q9CQI7 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Snrpb2Q9CQI7 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snrpb2Q9CQI7 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snrpb2Q9CQI7 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snrpb2Q9CQI7 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snrpb2Q9CQI7 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snrpb2Q9CQI7 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snrpb2Q9CQI7 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snrpb2Q9CQI7 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snrpb2Q9CQI7 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms