Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ48

Nudcd2, NudC domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd2Q9CQ48 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nudcd2Q9CQ48 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nudcd2Q9CQ48 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nudcd2Q9CQ48 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nudcd2Q9CQ48 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nudcd2Q9CQ48 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nudcd2Q9CQ48 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nudcd2Q9CQ48 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nudcd2Q9CQ48 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nudcd2Q9CQ48 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nudcd2Q9CQ48 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nudcd2Q9CQ48 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nudcd2Q9CQ48 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nudcd2Q9CQ48 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nudcd2Q9CQ48 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nudcd2Q9CQ48 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nudcd2Q9CQ48 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nudcd2Q9CQ48 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nudcd2Q9CQ48 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nudcd2Q9CQ48 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nudcd2Q9CQ48 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nudcd2Q9CQ48 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nudcd2Q9CQ48 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nudcd2Q9CQ48 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nudcd2Q9CQ48 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nudcd2Q9CQ48 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nudcd2Q9CQ48 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nudcd2Q9CQ48 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nudcd2Q9CQ48 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nudcd2Q9CQ48 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nudcd2Q9CQ48 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nudcd2Q9CQ48 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nudcd2Q9CQ48 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nudcd2Q9CQ48 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nudcd2Q9CQ48 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nudcd2Q9CQ48 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nudcd2Q9CQ48 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nudcd2Q9CQ48 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nudcd2Q9CQ48 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nudcd2Q9CQ48 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nudcd2Q9CQ48 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nudcd2Q9CQ48 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nudcd2Q9CQ48 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nudcd2Q9CQ48 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nudcd2Q9CQ48 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nudcd2Q9CQ48 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nudcd2Q9CQ48 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nudcd2Q9CQ48 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nudcd2Q9CQ48 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nudcd2Q9CQ48 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nudcd2Q9CQ48 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nudcd2Q9CQ48 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nudcd2Q9CQ48 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nudcd2Q9CQ48 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nudcd2Q9CQ48 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nudcd2Q9CQ48 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nudcd2Q9CQ48 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nudcd2Q9CQ48 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nudcd2Q9CQ48 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nudcd2Q9CQ48 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nudcd2Q9CQ48 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nudcd2Q9CQ48 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nudcd2Q9CQ48 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nudcd2Q9CQ48 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nudcd2Q9CQ48 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nudcd2Q9CQ48 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nudcd2Q9CQ48 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nudcd2Q9CQ48 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nudcd2Q9CQ48 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nudcd2Q9CQ48 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nudcd2Q9CQ48 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nudcd2Q9CQ48 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nudcd2Q9CQ48 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nudcd2Q9CQ48 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nudcd2Q9CQ48 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nudcd2Q9CQ48 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nudcd2Q9CQ48 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nudcd2Q9CQ48 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nudcd2Q9CQ48 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nudcd2Q9CQ48 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nudcd2Q9CQ48 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nudcd2Q9CQ48 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nudcd2Q9CQ48 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nudcd2Q9CQ48 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nudcd2Q9CQ48 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Nudcd2Q9CQ48 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nudcd2Q9CQ48 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nudcd2Q9CQ48 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nudcd2Q9CQ48 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nudcd2Q9CQ48 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nudcd2Q9CQ48 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nudcd2Q9CQ48 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nudcd2Q9CQ48 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nudcd2Q9CQ48 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nudcd2Q9CQ48 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nudcd2Q9CQ48 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nudcd2Q9CQ48 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nudcd2Q9CQ48 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nudcd2Q9CQ48 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nudcd2Q9CQ48 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms