Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bhlhe41Q99PV5 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bhlhe41Q99PV5 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bhlhe41Q99PV5 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bhlhe41Q99PV5 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bhlhe41Q99PV5 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bhlhe41Q99PV5 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bhlhe41Q99PV5 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Bhlhe41Q99PV5 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bhlhe41Q99PV5 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bhlhe41Q99PV5 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Bhlhe41Q99PV5 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bhlhe41Q99PV5 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bhlhe41Q99PV5 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bhlhe41Q99PV5 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bhlhe41Q99PV5 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bhlhe41Q99PV5 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bhlhe41Q99PV5 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bhlhe41Q99PV5 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bhlhe41Q99PV5 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bhlhe41Q99PV5 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bhlhe41Q99PV5 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bhlhe41Q99PV5 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bhlhe41Q99PV5 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bhlhe41Q99PV5 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bhlhe41Q99PV5 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bhlhe41Q99PV5 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bhlhe41Q99PV5 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bhlhe41Q99PV5 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bhlhe41Q99PV5 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bhlhe41Q99PV5 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Bhlhe41Q99PV5 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bhlhe41Q99PV5 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bhlhe41Q99PV5 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bhlhe41Q99PV5 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bhlhe41Q99PV5 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bhlhe41Q99PV5 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bhlhe41Q99PV5 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bhlhe41Q99PV5 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bhlhe41Q99PV5 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bhlhe41Q99PV5 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bhlhe41Q99PV5 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bhlhe41Q99PV5 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bhlhe41Q99PV5 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bhlhe41Q99PV5 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bhlhe41Q99PV5 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bhlhe41Q99PV5 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Bhlhe41Q99PV5 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bhlhe41Q99PV5 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bhlhe41Q99PV5 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bhlhe41Q99PV5 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bhlhe41Q99PV5 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bhlhe41Q99PV5 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bhlhe41Q99PV5 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bhlhe41Q99PV5 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Bhlhe41Q99PV5 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bhlhe41Q99PV5 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bhlhe41Q99PV5 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bhlhe41Q99PV5 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bhlhe41Q99PV5 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bhlhe41Q99PV5 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Bhlhe41Q99PV5 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bhlhe41Q99PV5 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bhlhe41Q99PV5 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Bhlhe41Q99PV5 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bhlhe41Q99PV5 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bhlhe41Q99PV5 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bhlhe41Q99PV5 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bhlhe41Q99PV5 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bhlhe41Q99PV5 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bhlhe41Q99PV5 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bhlhe41Q99PV5 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bhlhe41Q99PV5 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bhlhe41Q99PV5 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bhlhe41Q99PV5 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bhlhe41Q99PV5 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bhlhe41Q99PV5 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bhlhe41Q99PV5 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bhlhe41Q99PV5 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bhlhe41Q99PV5 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Bhlhe41Q99PV5 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bhlhe41Q99PV5 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bhlhe41Q99PV5 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bhlhe41Q99PV5 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bhlhe41Q99PV5 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bhlhe41Q99PV5 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bhlhe41Q99PV5 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bhlhe41Q99PV5 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bhlhe41Q99PV5 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bhlhe41Q99PV5 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bhlhe41Q99PV5 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bhlhe41Q99PV5 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bhlhe41Q99PV5 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bhlhe41Q99PV5 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bhlhe41Q99PV5 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bhlhe41Q99PV5 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Bhlhe41Q99PV5 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bhlhe41Q99PV5 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Bhlhe41Q99PV5 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bhlhe41Q99PV5 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms