Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR8

Mccc1, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase subunit alpha, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mccc1Q99MR8 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mccc1Q99MR8 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mccc1Q99MR8 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mccc1Q99MR8 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mccc1Q99MR8 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mccc1Q99MR8 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mccc1Q99MR8 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mccc1Q99MR8 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mccc1Q99MR8 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mccc1Q99MR8 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mccc1Q99MR8 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mccc1Q99MR8 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mccc1Q99MR8 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mccc1Q99MR8 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mccc1Q99MR8 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Mccc1Q99MR8 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mccc1Q99MR8 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mccc1Q99MR8 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mccc1Q99MR8 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mccc1Q99MR8 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mccc1Q99MR8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mccc1Q99MR8 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Mccc1Q99MR8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Mccc1Q99MR8 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mccc1Q99MR8 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mccc1Q99MR8 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mccc1Q99MR8 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mccc1Q99MR8 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mccc1Q99MR8 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mccc1Q99MR8 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mccc1Q99MR8 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mccc1Q99MR8 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mccc1Q99MR8 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mccc1Q99MR8 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mccc1Q99MR8 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mccc1Q99MR8 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mccc1Q99MR8 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mccc1Q99MR8 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mccc1Q99MR8 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Mccc1Q99MR8 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mccc1Q99MR8 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Mccc1Q99MR8 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mccc1Q99MR8 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mccc1Q99MR8 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mccc1Q99MR8 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mccc1Q99MR8 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mccc1Q99MR8 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mccc1Q99MR8 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Mccc1Q99MR8 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mccc1Q99MR8 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mccc1Q99MR8 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mccc1Q99MR8 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mccc1Q99MR8 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mccc1Q99MR8 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mccc1Q99MR8 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mccc1Q99MR8 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mccc1Q99MR8 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mccc1Q99MR8 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mccc1Q99MR8 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mccc1Q99MR8 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mccc1Q99MR8 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mccc1Q99MR8 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mccc1Q99MR8 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mccc1Q99MR8 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Mccc1Q99MR8 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Mccc1Q99MR8 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mccc1Q99MR8 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mccc1Q99MR8 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mccc1Q99MR8 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mccc1Q99MR8 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mccc1Q99MR8 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mccc1Q99MR8 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Mccc1Q99MR8 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mccc1Q99MR8 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mccc1Q99MR8 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mccc1Q99MR8 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mccc1Q99MR8 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mccc1Q99MR8 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mccc1Q99MR8 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mccc1Q99MR8 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mccc1Q99MR8 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mccc1Q99MR8 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mccc1Q99MR8 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mccc1Q99MR8 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Mccc1Q99MR8 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mccc1Q99MR8 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mccc1Q99MR8 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mccc1Q99MR8 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mccc1Q99MR8 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mccc1Q99MR8 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mccc1Q99MR8 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mccc1Q99MR8 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mccc1Q99MR8 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mccc1Q99MR8 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mccc1Q99MR8 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mccc1Q99MR8 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mccc1Q99MR8 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mccc1Q99MR8 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mccc1Q99MR8 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mccc1Q99MR8 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms