Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gdpd3Q99LY2 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gdpd3Q99LY2 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gdpd3Q99LY2 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gdpd3Q99LY2 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gdpd3Q99LY2 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gdpd3Q99LY2 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gdpd3Q99LY2 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gdpd3Q99LY2 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gdpd3Q99LY2 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gdpd3Q99LY2 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gdpd3Q99LY2 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gdpd3Q99LY2 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gdpd3Q99LY2 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gdpd3Q99LY2 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gdpd3Q99LY2 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gdpd3Q99LY2 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gdpd3Q99LY2 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gdpd3Q99LY2 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gdpd3Q99LY2 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gdpd3Q99LY2 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gdpd3Q99LY2 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gdpd3Q99LY2 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gdpd3Q99LY2 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gdpd3Q99LY2 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gdpd3Q99LY2 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gdpd3Q99LY2 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gdpd3Q99LY2 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gdpd3Q99LY2 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gdpd3Q99LY2 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gdpd3Q99LY2 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gdpd3Q99LY2 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gdpd3Q99LY2 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Gdpd3Q99LY2 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gdpd3Q99LY2 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gdpd3Q99LY2 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gdpd3Q99LY2 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gdpd3Q99LY2 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gdpd3Q99LY2 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gdpd3Q99LY2 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gdpd3Q99LY2 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gdpd3Q99LY2 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gdpd3Q99LY2 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gdpd3Q99LY2 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gdpd3Q99LY2 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gdpd3Q99LY2 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gdpd3Q99LY2 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gdpd3Q99LY2 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gdpd3Q99LY2 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gdpd3Q99LY2 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gdpd3Q99LY2 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gdpd3Q99LY2 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gdpd3Q99LY2 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gdpd3Q99LY2 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gdpd3Q99LY2 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gdpd3Q99LY2 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gdpd3Q99LY2 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gdpd3Q99LY2 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gdpd3Q99LY2 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gdpd3Q99LY2 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gdpd3Q99LY2 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gdpd3Q99LY2 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gdpd3Q99LY2 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gdpd3Q99LY2 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gdpd3Q99LY2 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gdpd3Q99LY2 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gdpd3Q99LY2 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gdpd3Q99LY2 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gdpd3Q99LY2 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gdpd3Q99LY2 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gdpd3Q99LY2 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gdpd3Q99LY2 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gdpd3Q99LY2 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gdpd3Q99LY2 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gdpd3Q99LY2 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gdpd3Q99LY2 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gdpd3Q99LY2 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gdpd3Q99LY2 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gdpd3Q99LY2 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gdpd3Q99LY2 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gdpd3Q99LY2 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gdpd3Q99LY2 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gdpd3Q99LY2 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gdpd3Q99LY2 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gdpd3Q99LY2 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gdpd3Q99LY2 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gdpd3Q99LY2 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gdpd3Q99LY2 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gdpd3Q99LY2 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gdpd3Q99LY2 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gdpd3Q99LY2 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gdpd3Q99LY2 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gdpd3Q99LY2 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gdpd3Q99LY2 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gdpd3Q99LY2 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gdpd3Q99LY2 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gdpd3Q99LY2 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gdpd3Q99LY2 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gdpd3Q99LY2 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gdpd3Q99LY2 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms