Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ciao1Q99KN2 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ciao1Q99KN2 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ciao1Q99KN2 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ciao1Q99KN2 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ciao1Q99KN2 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ciao1Q99KN2 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ciao1Q99KN2 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ciao1Q99KN2 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ciao1Q99KN2 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ciao1Q99KN2 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ciao1Q99KN2 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ciao1Q99KN2 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ciao1Q99KN2 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ciao1Q99KN2 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ciao1Q99KN2 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ciao1Q99KN2 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ciao1Q99KN2 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ciao1Q99KN2 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ciao1Q99KN2 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ciao1Q99KN2 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ciao1Q99KN2 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ciao1Q99KN2 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ciao1Q99KN2 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ciao1Q99KN2 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ciao1Q99KN2 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ciao1Q99KN2 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ciao1Q99KN2 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ciao1Q99KN2 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ciao1Q99KN2 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ciao1Q99KN2 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ciao1Q99KN2 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ciao1Q99KN2 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ciao1Q99KN2 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ciao1Q99KN2 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ciao1Q99KN2 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ciao1Q99KN2 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ciao1Q99KN2 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ciao1Q99KN2 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ciao1Q99KN2 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ciao1Q99KN2 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ciao1Q99KN2 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ciao1Q99KN2 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ciao1Q99KN2 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ciao1Q99KN2 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ciao1Q99KN2 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ciao1Q99KN2 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ciao1Q99KN2 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ciao1Q99KN2 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ciao1Q99KN2 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ciao1Q99KN2 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ciao1Q99KN2 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ciao1Q99KN2 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ciao1Q99KN2 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ciao1Q99KN2 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ciao1Q99KN2 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ciao1Q99KN2 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ciao1Q99KN2 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ciao1Q99KN2 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ciao1Q99KN2 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ciao1Q99KN2 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ciao1Q99KN2 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ciao1Q99KN2 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ciao1Q99KN2 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ciao1Q99KN2 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ciao1Q99KN2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ciao1Q99KN2 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ciao1Q99KN2 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ciao1Q99KN2 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ciao1Q99KN2 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ciao1Q99KN2 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ciao1Q99KN2 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ciao1Q99KN2 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ciao1Q99KN2 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ciao1Q99KN2 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ciao1Q99KN2 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ciao1Q99KN2 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ciao1Q99KN2 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ciao1Q99KN2 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ciao1Q99KN2 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ciao1Q99KN2 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ciao1Q99KN2 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ciao1Q99KN2 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ciao1Q99KN2 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ciao1Q99KN2 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ciao1Q99KN2 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ciao1Q99KN2 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ciao1Q99KN2 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ciao1Q99KN2 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ciao1Q99KN2 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ciao1Q99KN2 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ciao1Q99KN2 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ciao1Q99KN2 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ciao1Q99KN2 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ciao1Q99KN2 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ciao1Q99KN2 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ciao1Q99KN2 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ciao1Q99KN2 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ciao1Q99KN2 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ciao1Q99KN2 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms