Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp11Q99K46 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp11Q99K46 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp11Q99K46 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp11Q99K46 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp11Q99K46 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp11Q99K46 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp11Q99K46 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp11Q99K46 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp11Q99K46 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp11Q99K46 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp11Q99K46 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp11Q99K46 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp11Q99K46 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp11Q99K46 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp11Q99K46 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp11Q99K46 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp11Q99K46 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp11Q99K46 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp11Q99K46 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp11Q99K46 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp11Q99K46 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp11Q99K46 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp11Q99K46 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp11Q99K46 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp11Q99K46 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp11Q99K46 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp11Q99K46 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp11Q99K46 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp11Q99K46 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp11Q99K46 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp11Q99K46 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp11Q99K46 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp11Q99K46 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp11Q99K46 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp11Q99K46 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp11Q99K46 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp11Q99K46 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp11Q99K46 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp11Q99K46 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp11Q99K46 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp11Q99K46 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp11Q99K46 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp11Q99K46 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp11Q99K46 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp11Q99K46 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp11Q99K46 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp11Q99K46 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp11Q99K46 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp11Q99K46 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp11Q99K46 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp11Q99K46 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp11Q99K46 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp11Q99K46 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp11Q99K46 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp11Q99K46 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp11Q99K46 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp11Q99K46 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp11Q99K46 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp11Q99K46 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp11Q99K46 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp11Q99K46 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp11Q99K46 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp11Q99K46 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp11Q99K46 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp11Q99K46 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp11Q99K46 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp11Q99K46 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp11Q99K46 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp11Q99K46 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp11Q99K46 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp11Q99K46 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp11Q99K46 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp11Q99K46 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp11Q99K46 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp11Q99K46 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp11Q99K46 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp11Q99K46 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp11Q99K46 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp11Q99K46 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp11Q99K46 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp11Q99K46 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp11Q99K46 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp11Q99K46 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp11Q99K46 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp11Q99K46 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp11Q99K46 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp11Q99K46 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp11Q99K46 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp11Q99K46 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp11Q99K46 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp11Q99K46 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp11Q99K46 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp11Q99K46 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp11Q99K46 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp11Q99K46 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp11Q99K46 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp11Q99K46 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp11Q99K46 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp11Q99K46 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms