Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smim11aQ99J19 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smim11aQ99J19 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smim11aQ99J19 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smim11aQ99J19 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smim11aQ99J19 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Smim11aQ99J19 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smim11aQ99J19 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smim11aQ99J19 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smim11aQ99J19 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smim11aQ99J19 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smim11aQ99J19 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smim11aQ99J19 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smim11aQ99J19 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smim11aQ99J19 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smim11aQ99J19 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smim11aQ99J19 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smim11aQ99J19 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smim11aQ99J19 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smim11aQ99J19 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smim11aQ99J19 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smim11aQ99J19 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smim11aQ99J19 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smim11aQ99J19 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smim11aQ99J19 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smim11aQ99J19 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smim11aQ99J19 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smim11aQ99J19 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Smim11aQ99J19 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smim11aQ99J19 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smim11aQ99J19 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smim11aQ99J19 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smim11aQ99J19 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smim11aQ99J19 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smim11aQ99J19 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smim11aQ99J19 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smim11aQ99J19 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smim11aQ99J19 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smim11aQ99J19 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smim11aQ99J19 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smim11aQ99J19 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smim11aQ99J19 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smim11aQ99J19 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smim11aQ99J19 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smim11aQ99J19 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smim11aQ99J19 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smim11aQ99J19 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smim11aQ99J19 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smim11aQ99J19 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smim11aQ99J19 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smim11aQ99J19 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Smim11aQ99J19 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Smim11aQ99J19 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Smim11aQ99J19 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smim11aQ99J19 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smim11aQ99J19 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smim11aQ99J19 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smim11aQ99J19 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smim11aQ99J19 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Smim11aQ99J19 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smim11aQ99J19 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smim11aQ99J19 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smim11aQ99J19 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smim11aQ99J19 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smim11aQ99J19 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smim11aQ99J19 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smim11aQ99J19 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smim11aQ99J19 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smim11aQ99J19 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smim11aQ99J19 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smim11aQ99J19 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smim11aQ99J19 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smim11aQ99J19 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smim11aQ99J19 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smim11aQ99J19 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smim11aQ99J19 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smim11aQ99J19 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smim11aQ99J19 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smim11aQ99J19 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smim11aQ99J19 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smim11aQ99J19 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smim11aQ99J19 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smim11aQ99J19 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smim11aQ99J19 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smim11aQ99J19 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smim11aQ99J19 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smim11aQ99J19 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smim11aQ99J19 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smim11aQ99J19 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smim11aQ99J19 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smim11aQ99J19 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smim11aQ99J19 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smim11aQ99J19 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smim11aQ99J19 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smim11aQ99J19 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smim11aQ99J19 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Smim11aQ99J19 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smim11aQ99J19 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smim11aQ99J19 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smim11aQ99J19 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms