Protein–RNA interactions for Protein: Q920N1

Odf3, Outer dense fiber protein 3, mousemouse

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf3Q920N1 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Odf3Q920N1 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Odf3Q920N1 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Odf3Q920N1 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Odf3Q920N1 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Odf3Q920N1 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Odf3Q920N1 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Odf3Q920N1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Odf3Q920N1 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Odf3Q920N1 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Odf3Q920N1 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Odf3Q920N1 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Odf3Q920N1 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Odf3Q920N1 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Odf3Q920N1 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Odf3Q920N1 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Odf3Q920N1 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Odf3Q920N1 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Odf3Q920N1 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Odf3Q920N1 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Odf3Q920N1 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Odf3Q920N1 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Odf3Q920N1 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Odf3Q920N1 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Odf3Q920N1 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Odf3Q920N1 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Odf3Q920N1 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Odf3Q920N1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Odf3Q920N1 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Odf3Q920N1 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Odf3Q920N1 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Odf3Q920N1 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Odf3Q920N1 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Odf3Q920N1 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Odf3Q920N1 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Odf3Q920N1 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Odf3Q920N1 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Odf3Q920N1 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Odf3Q920N1 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Odf3Q920N1 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Odf3Q920N1 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Odf3Q920N1 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Odf3Q920N1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Odf3Q920N1 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Odf3Q920N1 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Odf3Q920N1 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Odf3Q920N1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Odf3Q920N1 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Odf3Q920N1 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Odf3Q920N1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Odf3Q920N1 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Odf3Q920N1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Odf3Q920N1 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Odf3Q920N1 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Odf3Q920N1 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Odf3Q920N1 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Odf3Q920N1 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Odf3Q920N1 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Odf3Q920N1 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Odf3Q920N1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Odf3Q920N1 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Odf3Q920N1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Odf3Q920N1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Odf3Q920N1 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Odf3Q920N1 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Odf3Q920N1 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Odf3Q920N1 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Odf3Q920N1 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Odf3Q920N1 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Odf3Q920N1 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Odf3Q920N1 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Odf3Q920N1 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Odf3Q920N1 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Odf3Q920N1 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Odf3Q920N1 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Odf3Q920N1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Odf3Q920N1 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Odf3Q920N1 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Odf3Q920N1 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Odf3Q920N1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Odf3Q920N1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Odf3Q920N1 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Odf3Q920N1 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Odf3Q920N1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Odf3Q920N1 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Odf3Q920N1 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Odf3Q920N1 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Odf3Q920N1 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Odf3Q920N1 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Odf3Q920N1 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Odf3Q920N1 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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