Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR2

Snx18, Sorting nexin-18, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx18Q91ZR2 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx18Q91ZR2 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx18Q91ZR2 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx18Q91ZR2 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx18Q91ZR2 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx18Q91ZR2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx18Q91ZR2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx18Q91ZR2 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snx18Q91ZR2 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snx18Q91ZR2 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snx18Q91ZR2 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snx18Q91ZR2 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snx18Q91ZR2 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snx18Q91ZR2 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx18Q91ZR2 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx18Q91ZR2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx18Q91ZR2 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx18Q91ZR2 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx18Q91ZR2 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx18Q91ZR2 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx18Q91ZR2 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx18Q91ZR2 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx18Q91ZR2 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx18Q91ZR2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx18Q91ZR2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx18Q91ZR2 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx18Q91ZR2 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx18Q91ZR2 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx18Q91ZR2 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx18Q91ZR2 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx18Q91ZR2 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx18Q91ZR2 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx18Q91ZR2 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx18Q91ZR2 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx18Q91ZR2 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx18Q91ZR2 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx18Q91ZR2 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx18Q91ZR2 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx18Q91ZR2 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx18Q91ZR2 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx18Q91ZR2 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx18Q91ZR2 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx18Q91ZR2 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx18Q91ZR2 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx18Q91ZR2 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx18Q91ZR2 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx18Q91ZR2 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx18Q91ZR2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx18Q91ZR2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx18Q91ZR2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx18Q91ZR2 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx18Q91ZR2 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx18Q91ZR2 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx18Q91ZR2 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx18Q91ZR2 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx18Q91ZR2 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx18Q91ZR2 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx18Q91ZR2 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx18Q91ZR2 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx18Q91ZR2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx18Q91ZR2 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx18Q91ZR2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx18Q91ZR2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx18Q91ZR2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx18Q91ZR2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx18Q91ZR2 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx18Q91ZR2 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx18Q91ZR2 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx18Q91ZR2 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx18Q91ZR2 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx18Q91ZR2 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx18Q91ZR2 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx18Q91ZR2 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx18Q91ZR2 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx18Q91ZR2 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx18Q91ZR2 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx18Q91ZR2 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx18Q91ZR2 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx18Q91ZR2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx18Q91ZR2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx18Q91ZR2 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx18Q91ZR2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx18Q91ZR2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx18Q91ZR2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx18Q91ZR2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx18Q91ZR2 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx18Q91ZR2 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx18Q91ZR2 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx18Q91ZR2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx18Q91ZR2 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx18Q91ZR2 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx18Q91ZR2 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx18Q91ZR2 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx18Q91ZR2 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx18Q91ZR2 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx18Q91ZR2 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx18Q91ZR2 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx18Q91ZR2 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx18Q91ZR2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx18Q91ZR2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms