Protein–RNA interactions for Protein: Q91XE9

Creb3l3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Creb3l3Q91XE9 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Creb3l3Q91XE9 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Creb3l3Q91XE9 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Creb3l3Q91XE9 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Creb3l3Q91XE9 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Creb3l3Q91XE9 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Creb3l3Q91XE9 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Creb3l3Q91XE9 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Creb3l3Q91XE9 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Creb3l3Q91XE9 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Creb3l3Q91XE9 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Creb3l3Q91XE9 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Creb3l3Q91XE9 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Creb3l3Q91XE9 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Creb3l3Q91XE9 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Creb3l3Q91XE9 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Creb3l3Q91XE9 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Creb3l3Q91XE9 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Creb3l3Q91XE9 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Creb3l3Q91XE9 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Creb3l3Q91XE9 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Creb3l3Q91XE9 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Creb3l3Q91XE9 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Creb3l3Q91XE9 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Creb3l3Q91XE9 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Creb3l3Q91XE9 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Creb3l3Q91XE9 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Creb3l3Q91XE9 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Creb3l3Q91XE9 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Creb3l3Q91XE9 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Creb3l3Q91XE9 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Creb3l3Q91XE9 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Creb3l3Q91XE9 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Creb3l3Q91XE9 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Creb3l3Q91XE9 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Creb3l3Q91XE9 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Creb3l3Q91XE9 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Creb3l3Q91XE9 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Creb3l3Q91XE9 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Creb3l3Q91XE9 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Creb3l3Q91XE9 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Creb3l3Q91XE9 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Creb3l3Q91XE9 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Creb3l3Q91XE9 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Creb3l3Q91XE9 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Creb3l3Q91XE9 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Creb3l3Q91XE9 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Creb3l3Q91XE9 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Creb3l3Q91XE9 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Creb3l3Q91XE9 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Creb3l3Q91XE9 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Creb3l3Q91XE9 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Creb3l3Q91XE9 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Creb3l3Q91XE9 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Creb3l3Q91XE9 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Creb3l3Q91XE9 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Creb3l3Q91XE9 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Creb3l3Q91XE9 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Creb3l3Q91XE9 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Creb3l3Q91XE9 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Creb3l3Q91XE9 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Creb3l3Q91XE9 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Creb3l3Q91XE9 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Creb3l3Q91XE9 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Creb3l3Q91XE9 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Creb3l3Q91XE9 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Creb3l3Q91XE9 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Creb3l3Q91XE9 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Creb3l3Q91XE9 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Creb3l3Q91XE9 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Creb3l3Q91XE9 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Creb3l3Q91XE9 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Creb3l3Q91XE9 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Creb3l3Q91XE9 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Creb3l3Q91XE9 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Creb3l3Q91XE9 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Creb3l3Q91XE9 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Creb3l3Q91XE9 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Creb3l3Q91XE9 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Creb3l3Q91XE9 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Creb3l3Q91XE9 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Creb3l3Q91XE9 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Creb3l3Q91XE9 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Creb3l3Q91XE9 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Creb3l3Q91XE9 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Creb3l3Q91XE9 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Creb3l3Q91XE9 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Creb3l3Q91XE9 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Creb3l3Q91XE9 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Creb3l3Q91XE9 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Creb3l3Q91XE9 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Creb3l3Q91XE9 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Creb3l3Q91XE9 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Creb3l3Q91XE9 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Creb3l3Q91XE9 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Creb3l3Q91XE9 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Creb3l3Q91XE9 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Creb3l3Q91XE9 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Creb3l3Q91XE9 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Creb3l3Q91XE9 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms