Protein–RNA interactions for Protein: Q8VIK3

H1foo, Histone H1oo, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H1fooQ8VIK3 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H1fooQ8VIK3 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H1fooQ8VIK3 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H1fooQ8VIK3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H1fooQ8VIK3 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H1fooQ8VIK3 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H1fooQ8VIK3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H1fooQ8VIK3 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H1fooQ8VIK3 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H1fooQ8VIK3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H1fooQ8VIK3 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H1fooQ8VIK3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H1fooQ8VIK3 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H1fooQ8VIK3 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H1fooQ8VIK3 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H1fooQ8VIK3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H1fooQ8VIK3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H1fooQ8VIK3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H1fooQ8VIK3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H1fooQ8VIK3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H1fooQ8VIK3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H1fooQ8VIK3 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H1fooQ8VIK3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H1fooQ8VIK3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H1fooQ8VIK3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H1fooQ8VIK3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H1fooQ8VIK3 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H1fooQ8VIK3 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H1fooQ8VIK3 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H1fooQ8VIK3 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H1fooQ8VIK3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H1fooQ8VIK3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H1fooQ8VIK3 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H1fooQ8VIK3 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
H1fooQ8VIK3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H1fooQ8VIK3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H1fooQ8VIK3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H1fooQ8VIK3 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H1fooQ8VIK3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H1fooQ8VIK3 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H1fooQ8VIK3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H1fooQ8VIK3 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H1fooQ8VIK3 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H1fooQ8VIK3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H1fooQ8VIK3 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H1fooQ8VIK3 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H1fooQ8VIK3 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
H1fooQ8VIK3 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H1fooQ8VIK3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H1fooQ8VIK3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H1fooQ8VIK3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H1fooQ8VIK3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H1fooQ8VIK3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H1fooQ8VIK3 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H1fooQ8VIK3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H1fooQ8VIK3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H1fooQ8VIK3 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H1fooQ8VIK3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H1fooQ8VIK3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H1fooQ8VIK3 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H1fooQ8VIK3 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H1fooQ8VIK3 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H1fooQ8VIK3 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H1fooQ8VIK3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H1fooQ8VIK3 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
H1fooQ8VIK3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H1fooQ8VIK3 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H1fooQ8VIK3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H1fooQ8VIK3 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H1fooQ8VIK3 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H1fooQ8VIK3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H1fooQ8VIK3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H1fooQ8VIK3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H1fooQ8VIK3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H1fooQ8VIK3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H1fooQ8VIK3 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
H1fooQ8VIK3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H1fooQ8VIK3 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H1fooQ8VIK3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H1fooQ8VIK3 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H1fooQ8VIK3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H1fooQ8VIK3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H1fooQ8VIK3 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H1fooQ8VIK3 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H1fooQ8VIK3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H1fooQ8VIK3 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H1fooQ8VIK3 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H1fooQ8VIK3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H1fooQ8VIK3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H1fooQ8VIK3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H1fooQ8VIK3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H1fooQ8VIK3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
H1fooQ8VIK3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H1fooQ8VIK3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H1fooQ8VIK3 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H1fooQ8VIK3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H1fooQ8VIK3 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H1fooQ8VIK3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H1fooQ8VIK3 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H1fooQ8VIK3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms