Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZS5

Rnf183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, mousemouse

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Length 190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf183Q8QZS5 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf183Q8QZS5 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf183Q8QZS5 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf183Q8QZS5 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf183Q8QZS5 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Rnf183Q8QZS5 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Rnf183Q8QZS5 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf183Q8QZS5 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf183Q8QZS5 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf183Q8QZS5 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf183Q8QZS5 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf183Q8QZS5 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf183Q8QZS5 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Rnf183Q8QZS5 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf183Q8QZS5 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf183Q8QZS5 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf183Q8QZS5 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf183Q8QZS5 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf183Q8QZS5 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Rnf183Q8QZS5 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Rnf183Q8QZS5 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf183Q8QZS5 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Rnf183Q8QZS5 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Rnf183Q8QZS5 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Rnf183Q8QZS5 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Rnf183Q8QZS5 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Rnf183Q8QZS5 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Rnf183Q8QZS5 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf183Q8QZS5 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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