Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F3

Depp1, Protein DEPP1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depp1Q8K2F3 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Depp1Q8K2F3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Depp1Q8K2F3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Depp1Q8K2F3 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Depp1Q8K2F3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Depp1Q8K2F3 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Depp1Q8K2F3 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Depp1Q8K2F3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Depp1Q8K2F3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Depp1Q8K2F3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Depp1Q8K2F3 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Depp1Q8K2F3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Depp1Q8K2F3 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Depp1Q8K2F3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Depp1Q8K2F3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Depp1Q8K2F3 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Depp1Q8K2F3 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Depp1Q8K2F3 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Depp1Q8K2F3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Depp1Q8K2F3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Depp1Q8K2F3 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Depp1Q8K2F3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Depp1Q8K2F3 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Depp1Q8K2F3 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Depp1Q8K2F3 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Depp1Q8K2F3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Depp1Q8K2F3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Depp1Q8K2F3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Depp1Q8K2F3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Depp1Q8K2F3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Depp1Q8K2F3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Depp1Q8K2F3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Depp1Q8K2F3 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Depp1Q8K2F3 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Depp1Q8K2F3 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Depp1Q8K2F3 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Depp1Q8K2F3 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Depp1Q8K2F3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Depp1Q8K2F3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Depp1Q8K2F3 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Depp1Q8K2F3 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Depp1Q8K2F3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Depp1Q8K2F3 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Depp1Q8K2F3 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Depp1Q8K2F3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Depp1Q8K2F3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Depp1Q8K2F3 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Depp1Q8K2F3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Depp1Q8K2F3 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Depp1Q8K2F3 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Depp1Q8K2F3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Depp1Q8K2F3 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Depp1Q8K2F3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Depp1Q8K2F3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Depp1Q8K2F3 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Depp1Q8K2F3 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Depp1Q8K2F3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Depp1Q8K2F3 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Depp1Q8K2F3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Depp1Q8K2F3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Depp1Q8K2F3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Depp1Q8K2F3 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Depp1Q8K2F3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Depp1Q8K2F3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Depp1Q8K2F3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Depp1Q8K2F3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Depp1Q8K2F3 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Depp1Q8K2F3 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Depp1Q8K2F3 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Depp1Q8K2F3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Depp1Q8K2F3 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Depp1Q8K2F3 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Depp1Q8K2F3 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Depp1Q8K2F3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Depp1Q8K2F3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Depp1Q8K2F3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Depp1Q8K2F3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Depp1Q8K2F3 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Depp1Q8K2F3 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Depp1Q8K2F3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Depp1Q8K2F3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Depp1Q8K2F3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Depp1Q8K2F3 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Depp1Q8K2F3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Depp1Q8K2F3 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Depp1Q8K2F3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Depp1Q8K2F3 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Depp1Q8K2F3 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Depp1Q8K2F3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Depp1Q8K2F3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Depp1Q8K2F3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Depp1Q8K2F3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Depp1Q8K2F3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Depp1Q8K2F3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Depp1Q8K2F3 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Depp1Q8K2F3 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Depp1Q8K2F3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Depp1Q8K2F3 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Depp1Q8K2F3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Depp1Q8K2F3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms