Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0Y2

Krt33a, Keratin, type I cuticular Ha3-I, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt33aQ8K0Y2 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt33aQ8K0Y2 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt33aQ8K0Y2 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt33aQ8K0Y2 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt33aQ8K0Y2 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt33aQ8K0Y2 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Krt33aQ8K0Y2 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt33aQ8K0Y2 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt33aQ8K0Y2 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt33aQ8K0Y2 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt33aQ8K0Y2 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt33aQ8K0Y2 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Krt33aQ8K0Y2 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt33aQ8K0Y2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt33aQ8K0Y2 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt33aQ8K0Y2 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt33aQ8K0Y2 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt33aQ8K0Y2 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt33aQ8K0Y2 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt33aQ8K0Y2 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt33aQ8K0Y2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt33aQ8K0Y2 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt33aQ8K0Y2 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt33aQ8K0Y2 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt33aQ8K0Y2 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt33aQ8K0Y2 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt33aQ8K0Y2 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt33aQ8K0Y2 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt33aQ8K0Y2 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt33aQ8K0Y2 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt33aQ8K0Y2 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt33aQ8K0Y2 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt33aQ8K0Y2 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt33aQ8K0Y2 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt33aQ8K0Y2 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt33aQ8K0Y2 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt33aQ8K0Y2 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt33aQ8K0Y2 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt33aQ8K0Y2 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt33aQ8K0Y2 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt33aQ8K0Y2 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt33aQ8K0Y2 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt33aQ8K0Y2 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt33aQ8K0Y2 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt33aQ8K0Y2 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt33aQ8K0Y2 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt33aQ8K0Y2 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt33aQ8K0Y2 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt33aQ8K0Y2 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt33aQ8K0Y2 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt33aQ8K0Y2 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt33aQ8K0Y2 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt33aQ8K0Y2 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt33aQ8K0Y2 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt33aQ8K0Y2 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt33aQ8K0Y2 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt33aQ8K0Y2 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt33aQ8K0Y2 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt33aQ8K0Y2 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt33aQ8K0Y2 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt33aQ8K0Y2 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt33aQ8K0Y2 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Krt33aQ8K0Y2 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Krt33aQ8K0Y2 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Krt33aQ8K0Y2 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt33aQ8K0Y2 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt33aQ8K0Y2 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt33aQ8K0Y2 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt33aQ8K0Y2 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt33aQ8K0Y2 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt33aQ8K0Y2 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt33aQ8K0Y2 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt33aQ8K0Y2 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt33aQ8K0Y2 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt33aQ8K0Y2 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt33aQ8K0Y2 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt33aQ8K0Y2 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt33aQ8K0Y2 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt33aQ8K0Y2 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt33aQ8K0Y2 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt33aQ8K0Y2 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt33aQ8K0Y2 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt33aQ8K0Y2 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt33aQ8K0Y2 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt33aQ8K0Y2 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt33aQ8K0Y2 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt33aQ8K0Y2 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt33aQ8K0Y2 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt33aQ8K0Y2 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt33aQ8K0Y2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt33aQ8K0Y2 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt33aQ8K0Y2 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt33aQ8K0Y2 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt33aQ8K0Y2 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt33aQ8K0Y2 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt33aQ8K0Y2 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt33aQ8K0Y2 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt33aQ8K0Y2 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt33aQ8K0Y2 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt33aQ8K0Y2 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms