Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SbsnQ8CIT9 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SbsnQ8CIT9 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SbsnQ8CIT9 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SbsnQ8CIT9 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SbsnQ8CIT9 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SbsnQ8CIT9 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SbsnQ8CIT9 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SbsnQ8CIT9 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SbsnQ8CIT9 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SbsnQ8CIT9 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SbsnQ8CIT9 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SbsnQ8CIT9 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SbsnQ8CIT9 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SbsnQ8CIT9 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SbsnQ8CIT9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SbsnQ8CIT9 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SbsnQ8CIT9 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SbsnQ8CIT9 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SbsnQ8CIT9 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SbsnQ8CIT9 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SbsnQ8CIT9 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SbsnQ8CIT9 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SbsnQ8CIT9 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SbsnQ8CIT9 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SbsnQ8CIT9 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SbsnQ8CIT9 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SbsnQ8CIT9 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SbsnQ8CIT9 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SbsnQ8CIT9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SbsnQ8CIT9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SbsnQ8CIT9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SbsnQ8CIT9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SbsnQ8CIT9 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SbsnQ8CIT9 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SbsnQ8CIT9 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SbsnQ8CIT9 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SbsnQ8CIT9 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SbsnQ8CIT9 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SbsnQ8CIT9 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SbsnQ8CIT9 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SbsnQ8CIT9 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SbsnQ8CIT9 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SbsnQ8CIT9 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SbsnQ8CIT9 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SbsnQ8CIT9 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SbsnQ8CIT9 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SbsnQ8CIT9 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SbsnQ8CIT9 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SbsnQ8CIT9 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SbsnQ8CIT9 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SbsnQ8CIT9 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SbsnQ8CIT9 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SbsnQ8CIT9 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SbsnQ8CIT9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SbsnQ8CIT9 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SbsnQ8CIT9 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SbsnQ8CIT9 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SbsnQ8CIT9 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SbsnQ8CIT9 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SbsnQ8CIT9 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SbsnQ8CIT9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SbsnQ8CIT9 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SbsnQ8CIT9 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SbsnQ8CIT9 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SbsnQ8CIT9 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SbsnQ8CIT9 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SbsnQ8CIT9 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SbsnQ8CIT9 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SbsnQ8CIT9 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SbsnQ8CIT9 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SbsnQ8CIT9 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SbsnQ8CIT9 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SbsnQ8CIT9 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SbsnQ8CIT9 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SbsnQ8CIT9 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SbsnQ8CIT9 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SbsnQ8CIT9 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SbsnQ8CIT9 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SbsnQ8CIT9 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SbsnQ8CIT9 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SbsnQ8CIT9 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SbsnQ8CIT9 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SbsnQ8CIT9 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SbsnQ8CIT9 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SbsnQ8CIT9 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SbsnQ8CIT9 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SbsnQ8CIT9 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SbsnQ8CIT9 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SbsnQ8CIT9 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SbsnQ8CIT9 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SbsnQ8CIT9 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SbsnQ8CIT9 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SbsnQ8CIT9 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SbsnQ8CIT9 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SbsnQ8CIT9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SbsnQ8CIT9 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SbsnQ8CIT9 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SbsnQ8CIT9 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SbsnQ8CIT9 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms