Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc17Q8CE13 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc17Q8CE13 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc17Q8CE13 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc17Q8CE13 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc17Q8CE13 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc17Q8CE13 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc17Q8CE13 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc17Q8CE13 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc17Q8CE13 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc17Q8CE13 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc17Q8CE13 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc17Q8CE13 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc17Q8CE13 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc17Q8CE13 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc17Q8CE13 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc17Q8CE13 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc17Q8CE13 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc17Q8CE13 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc17Q8CE13 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc17Q8CE13 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc17Q8CE13 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc17Q8CE13 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc17Q8CE13 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc17Q8CE13 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc17Q8CE13 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc17Q8CE13 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc17Q8CE13 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc17Q8CE13 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc17Q8CE13 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc17Q8CE13 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc17Q8CE13 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc17Q8CE13 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc17Q8CE13 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc17Q8CE13 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc17Q8CE13 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc17Q8CE13 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc17Q8CE13 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc17Q8CE13 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc17Q8CE13 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc17Q8CE13 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc17Q8CE13 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc17Q8CE13 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc17Q8CE13 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc17Q8CE13 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc17Q8CE13 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Ccdc17Q8CE13 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc17Q8CE13 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc17Q8CE13 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc17Q8CE13 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc17Q8CE13 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc17Q8CE13 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc17Q8CE13 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc17Q8CE13 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc17Q8CE13 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc17Q8CE13 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc17Q8CE13 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc17Q8CE13 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc17Q8CE13 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc17Q8CE13 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc17Q8CE13 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc17Q8CE13 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc17Q8CE13 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc17Q8CE13 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc17Q8CE13 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc17Q8CE13 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc17Q8CE13 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc17Q8CE13 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc17Q8CE13 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc17Q8CE13 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc17Q8CE13 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc17Q8CE13 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc17Q8CE13 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc17Q8CE13 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc17Q8CE13 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc17Q8CE13 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc17Q8CE13 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc17Q8CE13 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc17Q8CE13 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc17Q8CE13 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc17Q8CE13 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc17Q8CE13 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc17Q8CE13 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc17Q8CE13 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc17Q8CE13 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc17Q8CE13 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc17Q8CE13 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc17Q8CE13 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc17Q8CE13 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc17Q8CE13 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc17Q8CE13 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc17Q8CE13 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc17Q8CE13 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc17Q8CE13 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc17Q8CE13 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc17Q8CE13 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc17Q8CE13 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc17Q8CE13 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc17Q8CE13 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc17Q8CE13 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms