Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN8

Ccdc38, Coiled-coil domain-containing protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc38Q8CDN8 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc38Q8CDN8 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc38Q8CDN8 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc38Q8CDN8 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc38Q8CDN8 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc38Q8CDN8 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc38Q8CDN8 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc38Q8CDN8 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc38Q8CDN8 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc38Q8CDN8 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc38Q8CDN8 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc38Q8CDN8 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc38Q8CDN8 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc38Q8CDN8 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc38Q8CDN8 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc38Q8CDN8 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc38Q8CDN8 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc38Q8CDN8 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc38Q8CDN8 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc38Q8CDN8 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc38Q8CDN8 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc38Q8CDN8 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc38Q8CDN8 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc38Q8CDN8 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc38Q8CDN8 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc38Q8CDN8 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc38Q8CDN8 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc38Q8CDN8 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc38Q8CDN8 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc38Q8CDN8 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc38Q8CDN8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc38Q8CDN8 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc38Q8CDN8 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc38Q8CDN8 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc38Q8CDN8 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc38Q8CDN8 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc38Q8CDN8 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc38Q8CDN8 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc38Q8CDN8 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc38Q8CDN8 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc38Q8CDN8 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc38Q8CDN8 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc38Q8CDN8 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc38Q8CDN8 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc38Q8CDN8 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc38Q8CDN8 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc38Q8CDN8 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc38Q8CDN8 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc38Q8CDN8 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc38Q8CDN8 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc38Q8CDN8 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc38Q8CDN8 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc38Q8CDN8 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc38Q8CDN8 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc38Q8CDN8 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc38Q8CDN8 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc38Q8CDN8 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc38Q8CDN8 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc38Q8CDN8 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc38Q8CDN8 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc38Q8CDN8 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc38Q8CDN8 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc38Q8CDN8 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc38Q8CDN8 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc38Q8CDN8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc38Q8CDN8 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc38Q8CDN8 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc38Q8CDN8 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc38Q8CDN8 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc38Q8CDN8 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc38Q8CDN8 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc38Q8CDN8 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc38Q8CDN8 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc38Q8CDN8 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc38Q8CDN8 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc38Q8CDN8 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc38Q8CDN8 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc38Q8CDN8 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc38Q8CDN8 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc38Q8CDN8 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc38Q8CDN8 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc38Q8CDN8 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc38Q8CDN8 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc38Q8CDN8 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc38Q8CDN8 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc38Q8CDN8 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc38Q8CDN8 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc38Q8CDN8 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc38Q8CDN8 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc38Q8CDN8 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc38Q8CDN8 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc38Q8CDN8 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc38Q8CDN8 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc38Q8CDN8 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc38Q8CDN8 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc38Q8CDN8 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc38Q8CDN8 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc38Q8CDN8 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc38Q8CDN8 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc38Q8CDN8 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms