Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9M2

Ccdc15, Coiled-coil domain-containing protein 15, mousemouse

Predictions only

Length 810 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc15Q8C9M2 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc15Q8C9M2 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc15Q8C9M2 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc15Q8C9M2 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc15Q8C9M2 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc15Q8C9M2 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc15Q8C9M2 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc15Q8C9M2 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc15Q8C9M2 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc15Q8C9M2 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc15Q8C9M2 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc15Q8C9M2 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc15Q8C9M2 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc15Q8C9M2 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc15Q8C9M2 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc15Q8C9M2 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc15Q8C9M2 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc15Q8C9M2 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc15Q8C9M2 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc15Q8C9M2 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc15Q8C9M2 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc15Q8C9M2 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc15Q8C9M2 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc15Q8C9M2 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc15Q8C9M2 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc15Q8C9M2 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc15Q8C9M2 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc15Q8C9M2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc15Q8C9M2 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc15Q8C9M2 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc15Q8C9M2 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc15Q8C9M2 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc15Q8C9M2 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc15Q8C9M2 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc15Q8C9M2 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc15Q8C9M2 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc15Q8C9M2 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc15Q8C9M2 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc15Q8C9M2 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc15Q8C9M2 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc15Q8C9M2 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc15Q8C9M2 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc15Q8C9M2 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc15Q8C9M2 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc15Q8C9M2 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc15Q8C9M2 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc15Q8C9M2 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc15Q8C9M2 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc15Q8C9M2 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc15Q8C9M2 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc15Q8C9M2 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc15Q8C9M2 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc15Q8C9M2 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc15Q8C9M2 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc15Q8C9M2 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc15Q8C9M2 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc15Q8C9M2 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc15Q8C9M2 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc15Q8C9M2 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc15Q8C9M2 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc15Q8C9M2 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc15Q8C9M2 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc15Q8C9M2 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc15Q8C9M2 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc15Q8C9M2 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc15Q8C9M2 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc15Q8C9M2 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc15Q8C9M2 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc15Q8C9M2 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc15Q8C9M2 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc15Q8C9M2 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc15Q8C9M2 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc15Q8C9M2 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc15Q8C9M2 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc15Q8C9M2 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc15Q8C9M2 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc15Q8C9M2 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc15Q8C9M2 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc15Q8C9M2 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc15Q8C9M2 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc15Q8C9M2 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc15Q8C9M2 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc15Q8C9M2 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc15Q8C9M2 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc15Q8C9M2 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc15Q8C9M2 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc15Q8C9M2 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc15Q8C9M2 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc15Q8C9M2 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc15Q8C9M2 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc15Q8C9M2 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc15Q8C9M2 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc15Q8C9M2 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc15Q8C9M2 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc15Q8C9M2 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc15Q8C9M2 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc15Q8C9M2 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc15Q8C9M2 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc15Q8C9M2 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc15Q8C9M2 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms