Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg16l1Q8C0J2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg16l1Q8C0J2 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg16l1Q8C0J2 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg16l1Q8C0J2 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg16l1Q8C0J2 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg16l1Q8C0J2 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg16l1Q8C0J2 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg16l1Q8C0J2 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg16l1Q8C0J2 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg16l1Q8C0J2 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg16l1Q8C0J2 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg16l1Q8C0J2 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg16l1Q8C0J2 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg16l1Q8C0J2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg16l1Q8C0J2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg16l1Q8C0J2 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg16l1Q8C0J2 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg16l1Q8C0J2 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg16l1Q8C0J2 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atg16l1Q8C0J2 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atg16l1Q8C0J2 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atg16l1Q8C0J2 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atg16l1Q8C0J2 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atg16l1Q8C0J2 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atg16l1Q8C0J2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atg16l1Q8C0J2 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atg16l1Q8C0J2 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atg16l1Q8C0J2 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atg16l1Q8C0J2 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atg16l1Q8C0J2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Atg16l1Q8C0J2 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atg16l1Q8C0J2 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atg16l1Q8C0J2 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atg16l1Q8C0J2 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atg16l1Q8C0J2 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atg16l1Q8C0J2 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atg16l1Q8C0J2 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atg16l1Q8C0J2 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg16l1Q8C0J2 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg16l1Q8C0J2 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg16l1Q8C0J2 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg16l1Q8C0J2 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg16l1Q8C0J2 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg16l1Q8C0J2 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg16l1Q8C0J2 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg16l1Q8C0J2 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg16l1Q8C0J2 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg16l1Q8C0J2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg16l1Q8C0J2 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg16l1Q8C0J2 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg16l1Q8C0J2 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg16l1Q8C0J2 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg16l1Q8C0J2 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg16l1Q8C0J2 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg16l1Q8C0J2 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg16l1Q8C0J2 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg16l1Q8C0J2 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg16l1Q8C0J2 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg16l1Q8C0J2 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg16l1Q8C0J2 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg16l1Q8C0J2 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg16l1Q8C0J2 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg16l1Q8C0J2 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg16l1Q8C0J2 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg16l1Q8C0J2 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg16l1Q8C0J2 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg16l1Q8C0J2 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg16l1Q8C0J2 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg16l1Q8C0J2 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg16l1Q8C0J2 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg16l1Q8C0J2 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg16l1Q8C0J2 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg16l1Q8C0J2 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg16l1Q8C0J2 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg16l1Q8C0J2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg16l1Q8C0J2 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg16l1Q8C0J2 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg16l1Q8C0J2 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg16l1Q8C0J2 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg16l1Q8C0J2 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg16l1Q8C0J2 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg16l1Q8C0J2 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg16l1Q8C0J2 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg16l1Q8C0J2 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg16l1Q8C0J2 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg16l1Q8C0J2 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg16l1Q8C0J2 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg16l1Q8C0J2 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg16l1Q8C0J2 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg16l1Q8C0J2 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg16l1Q8C0J2 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg16l1Q8C0J2 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg16l1Q8C0J2 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg16l1Q8C0J2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg16l1Q8C0J2 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg16l1Q8C0J2 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg16l1Q8C0J2 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg16l1Q8C0J2 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg16l1Q8C0J2 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms