Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctdsp2Q8BX07 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctdsp2Q8BX07 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctdsp2Q8BX07 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctdsp2Q8BX07 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctdsp2Q8BX07 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctdsp2Q8BX07 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctdsp2Q8BX07 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctdsp2Q8BX07 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctdsp2Q8BX07 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctdsp2Q8BX07 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctdsp2Q8BX07 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctdsp2Q8BX07 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctdsp2Q8BX07 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctdsp2Q8BX07 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctdsp2Q8BX07 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctdsp2Q8BX07 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctdsp2Q8BX07 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctdsp2Q8BX07 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctdsp2Q8BX07 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctdsp2Q8BX07 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctdsp2Q8BX07 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctdsp2Q8BX07 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctdsp2Q8BX07 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctdsp2Q8BX07 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctdsp2Q8BX07 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctdsp2Q8BX07 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctdsp2Q8BX07 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctdsp2Q8BX07 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctdsp2Q8BX07 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctdsp2Q8BX07 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ctdsp2Q8BX07 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctdsp2Q8BX07 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctdsp2Q8BX07 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctdsp2Q8BX07 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctdsp2Q8BX07 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctdsp2Q8BX07 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctdsp2Q8BX07 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctdsp2Q8BX07 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctdsp2Q8BX07 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctdsp2Q8BX07 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctdsp2Q8BX07 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctdsp2Q8BX07 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctdsp2Q8BX07 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctdsp2Q8BX07 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctdsp2Q8BX07 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctdsp2Q8BX07 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctdsp2Q8BX07 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctdsp2Q8BX07 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctdsp2Q8BX07 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctdsp2Q8BX07 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctdsp2Q8BX07 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctdsp2Q8BX07 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctdsp2Q8BX07 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctdsp2Q8BX07 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctdsp2Q8BX07 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctdsp2Q8BX07 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctdsp2Q8BX07 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctdsp2Q8BX07 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctdsp2Q8BX07 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctdsp2Q8BX07 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctdsp2Q8BX07 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctdsp2Q8BX07 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctdsp2Q8BX07 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctdsp2Q8BX07 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctdsp2Q8BX07 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctdsp2Q8BX07 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctdsp2Q8BX07 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctdsp2Q8BX07 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctdsp2Q8BX07 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctdsp2Q8BX07 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctdsp2Q8BX07 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctdsp2Q8BX07 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctdsp2Q8BX07 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctdsp2Q8BX07 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctdsp2Q8BX07 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctdsp2Q8BX07 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctdsp2Q8BX07 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctdsp2Q8BX07 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctdsp2Q8BX07 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctdsp2Q8BX07 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctdsp2Q8BX07 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctdsp2Q8BX07 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctdsp2Q8BX07 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctdsp2Q8BX07 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctdsp2Q8BX07 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctdsp2Q8BX07 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctdsp2Q8BX07 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctdsp2Q8BX07 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctdsp2Q8BX07 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctdsp2Q8BX07 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctdsp2Q8BX07 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctdsp2Q8BX07 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctdsp2Q8BX07 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctdsp2Q8BX07 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctdsp2Q8BX07 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctdsp2Q8BX07 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctdsp2Q8BX07 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctdsp2Q8BX07 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctdsp2Q8BX07 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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