Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVA4

Lmod1, Leiomodin-1, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod1Q8BVA4 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lmod1Q8BVA4 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lmod1Q8BVA4 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lmod1Q8BVA4 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lmod1Q8BVA4 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lmod1Q8BVA4 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lmod1Q8BVA4 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lmod1Q8BVA4 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lmod1Q8BVA4 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lmod1Q8BVA4 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lmod1Q8BVA4 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lmod1Q8BVA4 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lmod1Q8BVA4 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lmod1Q8BVA4 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lmod1Q8BVA4 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lmod1Q8BVA4 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lmod1Q8BVA4 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lmod1Q8BVA4 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lmod1Q8BVA4 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lmod1Q8BVA4 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lmod1Q8BVA4 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Lmod1Q8BVA4 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Lmod1Q8BVA4 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lmod1Q8BVA4 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lmod1Q8BVA4 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lmod1Q8BVA4 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lmod1Q8BVA4 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lmod1Q8BVA4 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lmod1Q8BVA4 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lmod1Q8BVA4 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Lmod1Q8BVA4 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lmod1Q8BVA4 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lmod1Q8BVA4 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lmod1Q8BVA4 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lmod1Q8BVA4 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lmod1Q8BVA4 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lmod1Q8BVA4 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lmod1Q8BVA4 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lmod1Q8BVA4 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lmod1Q8BVA4 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lmod1Q8BVA4 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lmod1Q8BVA4 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lmod1Q8BVA4 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lmod1Q8BVA4 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lmod1Q8BVA4 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lmod1Q8BVA4 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lmod1Q8BVA4 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lmod1Q8BVA4 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Lmod1Q8BVA4 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lmod1Q8BVA4 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lmod1Q8BVA4 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lmod1Q8BVA4 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lmod1Q8BVA4 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lmod1Q8BVA4 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lmod1Q8BVA4 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lmod1Q8BVA4 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Lmod1Q8BVA4 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lmod1Q8BVA4 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lmod1Q8BVA4 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lmod1Q8BVA4 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lmod1Q8BVA4 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Lmod1Q8BVA4 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lmod1Q8BVA4 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lmod1Q8BVA4 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lmod1Q8BVA4 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lmod1Q8BVA4 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lmod1Q8BVA4 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lmod1Q8BVA4 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lmod1Q8BVA4 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lmod1Q8BVA4 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lmod1Q8BVA4 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Lmod1Q8BVA4 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Lmod1Q8BVA4 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lmod1Q8BVA4 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Lmod1Q8BVA4 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lmod1Q8BVA4 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lmod1Q8BVA4 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lmod1Q8BVA4 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lmod1Q8BVA4 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lmod1Q8BVA4 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lmod1Q8BVA4 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lmod1Q8BVA4 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lmod1Q8BVA4 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lmod1Q8BVA4 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lmod1Q8BVA4 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lmod1Q8BVA4 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lmod1Q8BVA4 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Lmod1Q8BVA4 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lmod1Q8BVA4 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lmod1Q8BVA4 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lmod1Q8BVA4 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lmod1Q8BVA4 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lmod1Q8BVA4 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lmod1Q8BVA4 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lmod1Q8BVA4 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lmod1Q8BVA4 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lmod1Q8BVA4 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lmod1Q8BVA4 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lmod1Q8BVA4 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lmod1Q8BVA4 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms