Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJN4

Fndc9, Fibronectin type III domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc9Q8BJN4 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fndc9Q8BJN4 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fndc9Q8BJN4 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Fndc9Q8BJN4 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fndc9Q8BJN4 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fndc9Q8BJN4 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fndc9Q8BJN4 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fndc9Q8BJN4 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fndc9Q8BJN4 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fndc9Q8BJN4 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fndc9Q8BJN4 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Fndc9Q8BJN4 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fndc9Q8BJN4 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fndc9Q8BJN4 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fndc9Q8BJN4 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fndc9Q8BJN4 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fndc9Q8BJN4 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fndc9Q8BJN4 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fndc9Q8BJN4 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fndc9Q8BJN4 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fndc9Q8BJN4 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fndc9Q8BJN4 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fndc9Q8BJN4 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fndc9Q8BJN4 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fndc9Q8BJN4 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fndc9Q8BJN4 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fndc9Q8BJN4 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Fndc9Q8BJN4 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fndc9Q8BJN4 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fndc9Q8BJN4 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fndc9Q8BJN4 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fndc9Q8BJN4 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fndc9Q8BJN4 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fndc9Q8BJN4 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fndc9Q8BJN4 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fndc9Q8BJN4 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fndc9Q8BJN4 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fndc9Q8BJN4 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fndc9Q8BJN4 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fndc9Q8BJN4 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fndc9Q8BJN4 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fndc9Q8BJN4 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fndc9Q8BJN4 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fndc9Q8BJN4 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fndc9Q8BJN4 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fndc9Q8BJN4 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fndc9Q8BJN4 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fndc9Q8BJN4 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fndc9Q8BJN4 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fndc9Q8BJN4 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fndc9Q8BJN4 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fndc9Q8BJN4 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fndc9Q8BJN4 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fndc9Q8BJN4 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fndc9Q8BJN4 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fndc9Q8BJN4 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fndc9Q8BJN4 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fndc9Q8BJN4 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fndc9Q8BJN4 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Fndc9Q8BJN4 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fndc9Q8BJN4 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fndc9Q8BJN4 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fndc9Q8BJN4 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fndc9Q8BJN4 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Fndc9Q8BJN4 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fndc9Q8BJN4 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fndc9Q8BJN4 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fndc9Q8BJN4 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fndc9Q8BJN4 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fndc9Q8BJN4 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fndc9Q8BJN4 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fndc9Q8BJN4 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fndc9Q8BJN4 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fndc9Q8BJN4 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fndc9Q8BJN4 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fndc9Q8BJN4 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Fndc9Q8BJN4 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Fndc9Q8BJN4 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fndc9Q8BJN4 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Fndc9Q8BJN4 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fndc9Q8BJN4 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fndc9Q8BJN4 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fndc9Q8BJN4 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fndc9Q8BJN4 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fndc9Q8BJN4 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fndc9Q8BJN4 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Fndc9Q8BJN4 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Fndc9Q8BJN4 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Fndc9Q8BJN4 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Fndc9Q8BJN4 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Fndc9Q8BJN4 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fndc9Q8BJN4 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fndc9Q8BJN4 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fndc9Q8BJN4 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fndc9Q8BJN4 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fndc9Q8BJN4 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Fndc9Q8BJN4 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Fndc9Q8BJN4 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Fndc9Q8BJN4 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fndc9Q8BJN4 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms