Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGY9

Slc5a7, High affinity choline transporter 1, mousemouse

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Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a7Q8BGY9 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Slc5a7Q8BGY9 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc5a7Q8BGY9 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc5a7Q8BGY9 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc5a7Q8BGY9 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc5a7Q8BGY9 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc5a7Q8BGY9 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc5a7Q8BGY9 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc5a7Q8BGY9 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc5a7Q8BGY9 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc5a7Q8BGY9 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc5a7Q8BGY9 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc5a7Q8BGY9 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc5a7Q8BGY9 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc5a7Q8BGY9 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc5a7Q8BGY9 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc5a7Q8BGY9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Slc5a7Q8BGY9 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc5a7Q8BGY9 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc5a7Q8BGY9 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc5a7Q8BGY9 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc5a7Q8BGY9 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc5a7Q8BGY9 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc5a7Q8BGY9 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc5a7Q8BGY9 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc5a7Q8BGY9 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc5a7Q8BGY9 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc5a7Q8BGY9 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc5a7Q8BGY9 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc5a7Q8BGY9 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc5a7Q8BGY9 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc5a7Q8BGY9 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
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Slc5a7Q8BGY9 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Slc5a7Q8BGY9 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Slc5a7Q8BGY9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Slc5a7Q8BGY9 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc5a7Q8BGY9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc5a7Q8BGY9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Slc5a7Q8BGY9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Slc5a7Q8BGY9 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc5a7Q8BGY9 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc5a7Q8BGY9 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc5a7Q8BGY9 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc5a7Q8BGY9 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc5a7Q8BGY9 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc5a7Q8BGY9 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc5a7Q8BGY9 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc5a7Q8BGY9 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc5a7Q8BGY9 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc5a7Q8BGY9 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc5a7Q8BGY9 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc5a7Q8BGY9 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc5a7Q8BGY9 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc5a7Q8BGY9 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc5a7Q8BGY9 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc5a7Q8BGY9 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc5a7Q8BGY9 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc5a7Q8BGY9 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc5a7Q8BGY9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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