Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGU0

Cyp4f39, Cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 39, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f39Q8BGU0 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cyp4f39Q8BGU0 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cyp4f39Q8BGU0 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cyp4f39Q8BGU0 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cyp4f39Q8BGU0 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cyp4f39Q8BGU0 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cyp4f39Q8BGU0 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cyp4f39Q8BGU0 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cyp4f39Q8BGU0 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cyp4f39Q8BGU0 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cyp4f39Q8BGU0 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cyp4f39Q8BGU0 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cyp4f39Q8BGU0 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cyp4f39Q8BGU0 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cyp4f39Q8BGU0 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cyp4f39Q8BGU0 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cyp4f39Q8BGU0 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cyp4f39Q8BGU0 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cyp4f39Q8BGU0 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Cyp4f39Q8BGU0 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cyp4f39Q8BGU0 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cyp4f39Q8BGU0 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cyp4f39Q8BGU0 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cyp4f39Q8BGU0 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cyp4f39Q8BGU0 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cyp4f39Q8BGU0 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cyp4f39Q8BGU0 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cyp4f39Q8BGU0 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cyp4f39Q8BGU0 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cyp4f39Q8BGU0 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cyp4f39Q8BGU0 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cyp4f39Q8BGU0 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cyp4f39Q8BGU0 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cyp4f39Q8BGU0 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cyp4f39Q8BGU0 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cyp4f39Q8BGU0 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cyp4f39Q8BGU0 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cyp4f39Q8BGU0 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cyp4f39Q8BGU0 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cyp4f39Q8BGU0 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cyp4f39Q8BGU0 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Cyp4f39Q8BGU0 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cyp4f39Q8BGU0 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cyp4f39Q8BGU0 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cyp4f39Q8BGU0 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cyp4f39Q8BGU0 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cyp4f39Q8BGU0 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cyp4f39Q8BGU0 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cyp4f39Q8BGU0 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cyp4f39Q8BGU0 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cyp4f39Q8BGU0 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cyp4f39Q8BGU0 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cyp4f39Q8BGU0 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cyp4f39Q8BGU0 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cyp4f39Q8BGU0 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cyp4f39Q8BGU0 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Cyp4f39Q8BGU0 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cyp4f39Q8BGU0 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cyp4f39Q8BGU0 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cyp4f39Q8BGU0 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cyp4f39Q8BGU0 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cyp4f39Q8BGU0 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cyp4f39Q8BGU0 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cyp4f39Q8BGU0 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cyp4f39Q8BGU0 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cyp4f39Q8BGU0 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cyp4f39Q8BGU0 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cyp4f39Q8BGU0 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cyp4f39Q8BGU0 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Cyp4f39Q8BGU0 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cyp4f39Q8BGU0 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cyp4f39Q8BGU0 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cyp4f39Q8BGU0 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cyp4f39Q8BGU0 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cyp4f39Q8BGU0 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cyp4f39Q8BGU0 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cyp4f39Q8BGU0 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cyp4f39Q8BGU0 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cyp4f39Q8BGU0 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cyp4f39Q8BGU0 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cyp4f39Q8BGU0 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cyp4f39Q8BGU0 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cyp4f39Q8BGU0 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cyp4f39Q8BGU0 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cyp4f39Q8BGU0 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cyp4f39Q8BGU0 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cyp4f39Q8BGU0 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cyp4f39Q8BGU0 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cyp4f39Q8BGU0 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cyp4f39Q8BGU0 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cyp4f39Q8BGU0 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cyp4f39Q8BGU0 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cyp4f39Q8BGU0 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cyp4f39Q8BGU0 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cyp4f39Q8BGU0 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cyp4f39Q8BGU0 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cyp4f39Q8BGU0 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cyp4f39Q8BGU0 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cyp4f39Q8BGU0 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cyp4f39Q8BGU0 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms