Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zbed4Q80WQ9 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zbed4Q80WQ9 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zbed4Q80WQ9 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zbed4Q80WQ9 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zbed4Q80WQ9 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zbed4Q80WQ9 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zbed4Q80WQ9 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zbed4Q80WQ9 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zbed4Q80WQ9 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Zbed4Q80WQ9 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Zbed4Q80WQ9 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zbed4Q80WQ9 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zbed4Q80WQ9 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zbed4Q80WQ9 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zbed4Q80WQ9 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zbed4Q80WQ9 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zbed4Q80WQ9 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zbed4Q80WQ9 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Zbed4Q80WQ9 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zbed4Q80WQ9 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zbed4Q80WQ9 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zbed4Q80WQ9 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zbed4Q80WQ9 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zbed4Q80WQ9 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zbed4Q80WQ9 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zbed4Q80WQ9 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zbed4Q80WQ9 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zbed4Q80WQ9 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zbed4Q80WQ9 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zbed4Q80WQ9 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zbed4Q80WQ9 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zbed4Q80WQ9 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zbed4Q80WQ9 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zbed4Q80WQ9 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zbed4Q80WQ9 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zbed4Q80WQ9 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zbed4Q80WQ9 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zbed4Q80WQ9 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zbed4Q80WQ9 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zbed4Q80WQ9 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zbed4Q80WQ9 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zbed4Q80WQ9 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zbed4Q80WQ9 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zbed4Q80WQ9 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zbed4Q80WQ9 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zbed4Q80WQ9 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zbed4Q80WQ9 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zbed4Q80WQ9 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zbed4Q80WQ9 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zbed4Q80WQ9 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zbed4Q80WQ9 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zbed4Q80WQ9 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zbed4Q80WQ9 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zbed4Q80WQ9 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zbed4Q80WQ9 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zbed4Q80WQ9 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Zbed4Q80WQ9 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zbed4Q80WQ9 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zbed4Q80WQ9 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zbed4Q80WQ9 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zbed4Q80WQ9 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zbed4Q80WQ9 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zbed4Q80WQ9 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zbed4Q80WQ9 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zbed4Q80WQ9 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zbed4Q80WQ9 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zbed4Q80WQ9 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zbed4Q80WQ9 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Zbed4Q80WQ9 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zbed4Q80WQ9 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zbed4Q80WQ9 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zbed4Q80WQ9 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zbed4Q80WQ9 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zbed4Q80WQ9 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zbed4Q80WQ9 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zbed4Q80WQ9 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zbed4Q80WQ9 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zbed4Q80WQ9 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zbed4Q80WQ9 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zbed4Q80WQ9 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zbed4Q80WQ9 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zbed4Q80WQ9 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zbed4Q80WQ9 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zbed4Q80WQ9 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zbed4Q80WQ9 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zbed4Q80WQ9 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zbed4Q80WQ9 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zbed4Q80WQ9 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zbed4Q80WQ9 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zbed4Q80WQ9 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zbed4Q80WQ9 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zbed4Q80WQ9 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zbed4Q80WQ9 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zbed4Q80WQ9 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zbed4Q80WQ9 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zbed4Q80WQ9 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Zbed4Q80WQ9 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Zbed4Q80WQ9 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zbed4Q80WQ9 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms