Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
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Pcsk9Q80W65 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pcsk9Q80W65 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pcsk9Q80W65 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pcsk9Q80W65 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pcsk9Q80W65 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pcsk9Q80W65 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
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Pcsk9Q80W65 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pcsk9Q80W65 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pcsk9Q80W65 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
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Pcsk9Q80W65 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pcsk9Q80W65 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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Pcsk9Q80W65 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pcsk9Q80W65 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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Pcsk9Q80W65 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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Pcsk9Q80W65 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pcsk9Q80W65 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pcsk9Q80W65 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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Pcsk9Q80W65 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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Pcsk9Q80W65 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pcsk9Q80W65 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pcsk9Q80W65 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pcsk9Q80W65 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pcsk9Q80W65 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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Pcsk9Q80W65 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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Pcsk9Q80W65 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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Pcsk9Q80W65 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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Pcsk9Q80W65 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pcsk9Q80W65 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pcsk9Q80W65 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pcsk9Q80W65 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pcsk9Q80W65 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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Pcsk9Q80W65 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pcsk9Q80W65 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pcsk9Q80W65 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pcsk9Q80W65 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pcsk9Q80W65 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pcsk9Q80W65 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pcsk9Q80W65 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pcsk9Q80W65 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pcsk9Q80W65 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pcsk9Q80W65 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pcsk9Q80W65 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pcsk9Q80W65 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pcsk9Q80W65 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pcsk9Q80W65 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pcsk9Q80W65 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pcsk9Q80W65 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pcsk9Q80W65 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pcsk9Q80W65 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pcsk9Q80W65 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pcsk9Q80W65 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pcsk9Q80W65 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms