Protein–RNA interactions for Protein: Q80US4

Actr5, Actin-related protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 605 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actr5Q80US4 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Actr5Q80US4 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Actr5Q80US4 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Actr5Q80US4 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Actr5Q80US4 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Actr5Q80US4 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Actr5Q80US4 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Actr5Q80US4 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Actr5Q80US4 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Actr5Q80US4 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Actr5Q80US4 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Actr5Q80US4 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Actr5Q80US4 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Actr5Q80US4 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Actr5Q80US4 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Actr5Q80US4 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Actr5Q80US4 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Actr5Q80US4 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Actr5Q80US4 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Actr5Q80US4 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Actr5Q80US4 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Actr5Q80US4 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Actr5Q80US4 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Actr5Q80US4 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Actr5Q80US4 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Actr5Q80US4 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Actr5Q80US4 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Actr5Q80US4 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Actr5Q80US4 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Actr5Q80US4 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Actr5Q80US4 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Actr5Q80US4 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Actr5Q80US4 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Actr5Q80US4 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Actr5Q80US4 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Actr5Q80US4 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Actr5Q80US4 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Actr5Q80US4 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Actr5Q80US4 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Actr5Q80US4 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Actr5Q80US4 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Actr5Q80US4 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Actr5Q80US4 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Actr5Q80US4 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Actr5Q80US4 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Actr5Q80US4 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Actr5Q80US4 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Actr5Q80US4 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Actr5Q80US4 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Actr5Q80US4 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Actr5Q80US4 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Actr5Q80US4 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Actr5Q80US4 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Actr5Q80US4 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Actr5Q80US4 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Actr5Q80US4 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Actr5Q80US4 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Actr5Q80US4 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Actr5Q80US4 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Actr5Q80US4 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Actr5Q80US4 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Actr5Q80US4 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Actr5Q80US4 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Actr5Q80US4 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Actr5Q80US4 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Actr5Q80US4 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Actr5Q80US4 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Actr5Q80US4 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Actr5Q80US4 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Actr5Q80US4 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Actr5Q80US4 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Actr5Q80US4 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Actr5Q80US4 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Actr5Q80US4 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Actr5Q80US4 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Actr5Q80US4 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Actr5Q80US4 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Actr5Q80US4 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Actr5Q80US4 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Actr5Q80US4 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Actr5Q80US4 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Actr5Q80US4 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Actr5Q80US4 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Actr5Q80US4 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Actr5Q80US4 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Actr5Q80US4 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Actr5Q80US4 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Actr5Q80US4 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Actr5Q80US4 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Actr5Q80US4 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Actr5Q80US4 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Actr5Q80US4 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Actr5Q80US4 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Actr5Q80US4 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Actr5Q80US4 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Actr5Q80US4 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Actr5Q80US4 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Actr5Q80US4 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Actr5Q80US4 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Actr5Q80US4 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms