Protein–RNA interactions for Protein: Q80T74

Klhl29, Kelch-like protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 875 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl29Q80T74 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
Klhl29Q80T74 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Klhl29Q80T74 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Klhl29Q80T74 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Klhl29Q80T74 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Klhl29Q80T74 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Klhl29Q80T74 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Klhl29Q80T74 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Klhl29Q80T74 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Klhl29Q80T74 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Klhl29Q80T74 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Klhl29Q80T74 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Klhl29Q80T74 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Klhl29Q80T74 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Klhl29Q80T74 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Klhl29Q80T74 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Klhl29Q80T74 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Klhl29Q80T74 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Klhl29Q80T74 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Klhl29Q80T74 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Klhl29Q80T74 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Klhl29Q80T74 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Klhl29Q80T74 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Klhl29Q80T74 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Klhl29Q80T74 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Klhl29Q80T74 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Klhl29Q80T74 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Klhl29Q80T74 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Klhl29Q80T74 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Klhl29Q80T74 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Klhl29Q80T74 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Klhl29Q80T74 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Klhl29Q80T74 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Klhl29Q80T74 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Klhl29Q80T74 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Klhl29Q80T74 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Klhl29Q80T74 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Klhl29Q80T74 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Klhl29Q80T74 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Klhl29Q80T74 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Klhl29Q80T74 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Klhl29Q80T74 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Klhl29Q80T74 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Klhl29Q80T74 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Klhl29Q80T74 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Klhl29Q80T74 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Klhl29Q80T74 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Klhl29Q80T74 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Klhl29Q80T74 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Klhl29Q80T74 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Klhl29Q80T74 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Klhl29Q80T74 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Klhl29Q80T74 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Klhl29Q80T74 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klhl29Q80T74 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klhl29Q80T74 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klhl29Q80T74 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klhl29Q80T74 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klhl29Q80T74 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klhl29Q80T74 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klhl29Q80T74 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klhl29Q80T74 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klhl29Q80T74 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klhl29Q80T74 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klhl29Q80T74 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klhl29Q80T74 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klhl29Q80T74 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klhl29Q80T74 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klhl29Q80T74 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klhl29Q80T74 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klhl29Q80T74 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klhl29Q80T74 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Klhl29Q80T74 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klhl29Q80T74 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Klhl29Q80T74 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klhl29Q80T74 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klhl29Q80T74 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klhl29Q80T74 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klhl29Q80T74 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Klhl29Q80T74 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klhl29Q80T74 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klhl29Q80T74 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klhl29Q80T74 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klhl29Q80T74 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klhl29Q80T74 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klhl29Q80T74 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klhl29Q80T74 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Klhl29Q80T74 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Klhl29Q80T74 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Klhl29Q80T74 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Klhl29Q80T74 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Klhl29Q80T74 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Klhl29Q80T74 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Klhl29Q80T74 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Klhl29Q80T74 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Klhl29Q80T74 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Klhl29Q80T74 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Klhl29Q80T74 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Klhl29Q80T74 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Klhl29Q80T74 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms