Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

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Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ScocQ78YZ6 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ScocQ78YZ6 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ScocQ78YZ6 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ScocQ78YZ6 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ScocQ78YZ6 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ScocQ78YZ6 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ScocQ78YZ6 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ScocQ78YZ6 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ScocQ78YZ6 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ScocQ78YZ6 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ScocQ78YZ6 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ScocQ78YZ6 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ScocQ78YZ6 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ScocQ78YZ6 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ScocQ78YZ6 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ScocQ78YZ6 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ScocQ78YZ6 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ScocQ78YZ6 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ScocQ78YZ6 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ScocQ78YZ6 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ScocQ78YZ6 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ScocQ78YZ6 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ScocQ78YZ6 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ScocQ78YZ6 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ScocQ78YZ6 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ScocQ78YZ6 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ScocQ78YZ6 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ScocQ78YZ6 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ScocQ78YZ6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ScocQ78YZ6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ScocQ78YZ6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ScocQ78YZ6 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ScocQ78YZ6 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ScocQ78YZ6 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ScocQ78YZ6 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ScocQ78YZ6 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ScocQ78YZ6 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ScocQ78YZ6 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ScocQ78YZ6 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ScocQ78YZ6 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ScocQ78YZ6 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ScocQ78YZ6 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ScocQ78YZ6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ScocQ78YZ6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ScocQ78YZ6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ScocQ78YZ6 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ScocQ78YZ6 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ScocQ78YZ6 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ScocQ78YZ6 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ScocQ78YZ6 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ScocQ78YZ6 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ScocQ78YZ6 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ScocQ78YZ6 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ScocQ78YZ6 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ScocQ78YZ6 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ScocQ78YZ6 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ScocQ78YZ6 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ScocQ78YZ6 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ScocQ78YZ6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ScocQ78YZ6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ScocQ78YZ6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ScocQ78YZ6 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ScocQ78YZ6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ScocQ78YZ6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ScocQ78YZ6 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ScocQ78YZ6 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ScocQ78YZ6 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ScocQ78YZ6 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ScocQ78YZ6 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ScocQ78YZ6 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ScocQ78YZ6 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ScocQ78YZ6 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ScocQ78YZ6 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ScocQ78YZ6 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ScocQ78YZ6 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ScocQ78YZ6 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ScocQ78YZ6 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ScocQ78YZ6 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ScocQ78YZ6 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ScocQ78YZ6 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ScocQ78YZ6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ScocQ78YZ6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ScocQ78YZ6 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ScocQ78YZ6 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ScocQ78YZ6 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ScocQ78YZ6 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ScocQ78YZ6 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ScocQ78YZ6 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ScocQ78YZ6 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ScocQ78YZ6 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ScocQ78YZ6 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ScocQ78YZ6 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ScocQ78YZ6 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ScocQ78YZ6 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ScocQ78YZ6 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ScocQ78YZ6 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ScocQ78YZ6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ScocQ78YZ6 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ScocQ78YZ6 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 142.3 ms